284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1112 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1112  Mannitol dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 464 aa  936    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0894  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  68.4 
 
 		 467 aa  635    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0134  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  72.23 
 
 		 465 aa  652    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5592  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  70.13 
 
 		 474 aa  626  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3167  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  66.67 
 
 		 468 aa  584  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00309741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5916  mannitol dehydrogenase  64.49 
 
 		 464 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2504  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  64.35 
 
 		 464 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  0.524531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0498  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  61.96 
 
 		 469 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2633  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  64.13 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1975  mannitol dehydrogenase-like  63.62 
 
 		 464 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2585  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  63.62 
 
 		 464 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0779102  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2609  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  63.4 
 
 		 464 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3238  Mannitol dehydrogenase domain  60.43 
 
 		 470 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.794946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0703  mannitol dehydrogenase family protein  63.26 
 
 		 463 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0730  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  60.56 
 
 		 470 aa  544  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0712  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  64.05 
 
 		 464 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466238 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0885  mannitol dehydrogenase family protein  63.04 
 
 		 496 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0888  mannitol dehydrogenase family protein  63.04 
 
 		 480 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0224596  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0344  mannitol dehydrogenase family protein  62.83 
 
 		 463 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1047  mannitol dehydrogenase family protein  63.04 
 
 		 463 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0643  mannitol dehydrogenase family protein  62.83 
 
 		 480 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0783605  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2478  mannitol dehydrogenase family protein  62.83 
 
 		 480 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.927953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0091  mannitol dehydrogenase family protein  62.83 
 
 		 480 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000701131  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2129  putative D-arabinitol dehydrogenase oxidoreductase protein  61.62 
 
 		 465 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1922  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  56.19 
 
 		 463 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1812  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  55.97 
 
 		 463 aa  514  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2216  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  55.97 
 
 		 463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1090  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.16 
 
 		 476 aa  314  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  38.69 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.93 
 
 		 491 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  39.34 
 
 		 491 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  39.8 
 
 		 491 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  36.86 
 
 		 493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  39.74 
 
 		 491 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  38.99 
 
 		 490 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  42.16 
 
 		 492 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  37.1 
 
 		 493 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  37.44 
 
 		 497 aa  264  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  40.51 
 
 		 503 aa  264  3e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.4 
 
 		 505 aa  263  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  37.22 
 
 		 497 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.72 
 
 		 494 aa  259  8e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.39 
 
 		 477 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.46 
 
 		 485 aa  257  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  39.13 
 
 		 477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  35.97 
 
 		 492 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.01 
 
 		 493 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.46 
 
 		 472 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.17 
 
 		 460 aa  246  9e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.17 
 
 		 460 aa  246  9e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  33.87 
 
 		 495 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.24 
 
 		 659 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.13 
 
 		 477 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  34.88 
 
 		 484 aa  244  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  33.78 
 
 		 472 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  33.78 
 
 		 472 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  38.58 
 
 		 499 aa  242  9e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.74 
 
 		 506 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  37.82 
 
 		 496 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.42 
 
 		 589 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  39.03 
 
 		 486 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  35.4 
 
 		 493 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.64 
 
 		 488 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3764  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.85 
 
 		 495 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00857831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  34.44 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.29 
 
 		 487 aa  237  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  33.33 
 
 		 494 aa  237  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2907  mannitol dehydrogenase-like  41.79 
 
 		 499 aa  236  6e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554349 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.15 
 
 		 492 aa  236  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  36.29 
 
 		 493 aa  236  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  34.73 
 
 		 497 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3727  mannitol dehydrogenase Rossman-like  38.38 
 
 		 509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4641  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.38 
 
 		 509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0969  mannitol dehydrogenase domain protein  38.24 
 
 		 499 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.124507 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.44 
 
 		 509 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733675 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2666  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.7 
 
 		 499 aa  233  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.4 
 
 		 505 aa  233  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  35.66 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.66 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  35.66 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  35.43 
 
 		 486 aa  231  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  33.84 
 
 		 490 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.68 
 
 		 494 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.74 
 
 		 509 aa  230  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  35.43 
 
 		 486 aa  229  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  35.43 
 
 		 486 aa  229  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  38.23 
 
 		 506 aa  229  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  35.43 
 
 		 486 aa  229  8e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  35.28 
 
 		 486 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  37.28 
 
 		 492 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  37.62 
 
 		 451 aa  227  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  35.7 
 
 		 458 aa  227  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  34.18 
 
 		 487 aa  226  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  36.95 
 
 		 485 aa  225  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  37.05 
 
 		 459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  41.05 
 
 		 510 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  34.73 
 
 		 486 aa  223  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  30.62 
 
 		 502 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  34.99 
 
 		 486 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.73 
 
 		 486 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>