290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0643 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2129  putative D-arabinitol dehydrogenase oxidoreductase protein  79.39 
 
 
465 aa  699    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288509  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0344  mannitol dehydrogenase family protein  100 
 
 
463 aa  925    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2609  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  83.33 
 
 
464 aa  758    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566868  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1047  mannitol dehydrogenase family protein  98.92 
 
 
463 aa  915    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2504  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  83.12 
 
 
464 aa  761    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  0.524531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5916  mannitol dehydrogenase  82.9 
 
 
464 aa  764    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0703  mannitol dehydrogenase family protein  93.95 
 
 
463 aa  871    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0730  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  75.11 
 
 
470 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1975  mannitol dehydrogenase-like  82.9 
 
 
464 aa  756    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3238  Mannitol dehydrogenase domain  74.45 
 
 
470 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.794946  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2633  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  82.9 
 
 
464 aa  759    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0498  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  73.55 
 
 
469 aa  698    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884765 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2585  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  82.9 
 
 
464 aa  756    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0779102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0643  mannitol dehydrogenase family protein  100 
 
 
480 aa  962    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0783605  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2478  mannitol dehydrogenase family protein  100 
 
 
480 aa  962    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.927953  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0712  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  84.2 
 
 
464 aa  758    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.466238 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0885  mannitol dehydrogenase family protein  99.17 
 
 
496 aa  953    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0888  mannitol dehydrogenase family protein  99.38 
 
 
480 aa  953    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0224596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0091  mannitol dehydrogenase family protein  100 
 
 
480 aa  962    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000701131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1112  Mannitol dehydrogenase domain protein  64.01 
 
 
464 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1922  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  56.68 
 
 
463 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2216  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  56.47 
 
 
463 aa  535  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1812  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  56.47 
 
 
463 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0134  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  61.21 
 
 
465 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0894  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.57 
 
 
467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3167  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  60.26 
 
 
468 aa  499  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00309741  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5592  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.94 
 
 
474 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1090  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.99 
 
 
476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  42.22 
 
 
491 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.45 
 
 
491 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  41.03 
 
 
491 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.72 
 
 
494 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.14 
 
 
505 aa  276  8e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  40.46 
 
 
497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  42.66 
 
 
493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  39.23 
 
 
497 aa  273  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  42.48 
 
 
491 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  40.94 
 
 
490 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  40.8 
 
 
493 aa  269  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  41.95 
 
 
491 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  42.78 
 
 
503 aa  264  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.59 
 
 
506 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  41.42 
 
 
486 aa  265  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.45 
 
 
492 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  42.93 
 
 
492 aa  262  8.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2907  mannitol dehydrogenase-like  40.09 
 
 
499 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  38.72 
 
 
497 aa  260  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.49 
 
 
477 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  41.49 
 
 
477 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  35.73 
 
 
500 aa  253  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.11 
 
 
472 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.64 
 
 
477 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.35 
 
 
494 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  37.18 
 
 
472 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.18 
 
 
472 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  39.19 
 
 
496 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3727  mannitol dehydrogenase Rossman-like  40.98 
 
 
509 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.81 
 
 
494 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4641  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.98 
 
 
509 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.98 
 
 
509 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733675 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  32.59 
 
 
484 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  34.98 
 
 
495 aa  246  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37 
 
 
659 aa  246  8e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  37.85 
 
 
493 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  37.09 
 
 
493 aa  242  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.39 
 
 
488 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0969  mannitol dehydrogenase domain protein  39.77 
 
 
499 aa  239  5.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.124507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.89 
 
 
485 aa  239  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.33 
 
 
487 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.48 
 
 
460 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.48 
 
 
460 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  40.36 
 
 
506 aa  238  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.53 
 
 
589 aa  238  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  40.15 
 
 
499 aa  236  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  39.59 
 
 
510 aa  234  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  33.92 
 
 
502 aa  233  6e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  34.2 
 
 
492 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  34.91 
 
 
492 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.76 
 
 
528 aa  231  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.9 
 
 
493 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3764  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.85 
 
 
495 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00857831  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  37.15 
 
 
490 aa  229  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  41.58 
 
 
430 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.66 
 
 
497 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  37.25 
 
 
492 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  35.38 
 
 
520 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  35.26 
 
 
490 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  34.63 
 
 
490 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  35.01 
 
 
490 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  34.63 
 
 
490 aa  223  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.94 
 
 
495 aa  220  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3649  mannitol dehydrogenase Rossman-like  33.65 
 
 
485 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0357773  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.68 
 
 
509 aa  217  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  32.88 
 
 
495 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  34.14 
 
 
490 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  36.46 
 
 
488 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  35.84 
 
 
489 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  36.46 
 
 
488 aa  216  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  37.26 
 
 
486 aa  216  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  36.89 
 
 
486 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>