289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3764 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3764  Mannitol dehydrogenase domain protein  100 
 
 
495 aa  1021    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00857831  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  36.03 
 
 
497 aa  312  9e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  38.27 
 
 
491 aa  310  5e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  35.71 
 
 
472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.71 
 
 
472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.71 
 
 
472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  36.53 
 
 
500 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  35.86 
 
 
503 aa  303  5.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  34.05 
 
 
484 aa  302  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  38.19 
 
 
493 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.02 
 
 
492 aa  293  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  38.37 
 
 
490 aa  292  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  32.09 
 
 
497 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  37.47 
 
 
493 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.45 
 
 
506 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.47 
 
 
505 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  32.8 
 
 
497 aa  286  5.999999999999999e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  35.24 
 
 
491 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.43 
 
 
494 aa  280  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.1 
 
 
491 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  36.59 
 
 
491 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  34.58 
 
 
491 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  35 
 
 
488 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  32.01 
 
 
528 aa  256  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  34.14 
 
 
486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.14 
 
 
486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  34.14 
 
 
486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  33.47 
 
 
493 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1090  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.28 
 
 
476 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694666 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.63 
 
 
487 aa  254  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  32.96 
 
 
502 aa  253  5.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  32.2 
 
 
493 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  33.66 
 
 
486 aa  252  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.96 
 
 
659 aa  252  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  33.66 
 
 
486 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  33.66 
 
 
486 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  33.66 
 
 
486 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  33.66 
 
 
486 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  30.48 
 
 
499 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  32.03 
 
 
490 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  32.03 
 
 
490 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  32.03 
 
 
490 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.97 
 
 
495 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  32.03 
 
 
490 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  31.91 
 
 
497 aa  246  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.67 
 
 
589 aa  245  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  33.5 
 
 
506 aa  244  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.87 
 
 
494 aa  244  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  31.82 
 
 
490 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.08 
 
 
494 aa  243  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.75 
 
 
495 aa  243  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.36 
 
 
477 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3727  mannitol dehydrogenase Rossman-like  35.14 
 
 
509 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4641  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.14 
 
 
509 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.88 
 
 
509 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733675 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.72 
 
 
477 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  36.12 
 
 
486 aa  240  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  31.14 
 
 
477 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  30.25 
 
 
492 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  32.19 
 
 
487 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1112  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.85 
 
 
464 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  29.73 
 
 
520 aa  236  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  31.06 
 
 
505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  31.55 
 
 
495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5592  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.61 
 
 
474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  32.85 
 
 
498 aa  234  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  33.03 
 
 
510 aa  234  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1922  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.03 
 
 
463 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.37 
 
 
486 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1812  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  35.03 
 
 
463 aa  233  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  29.29 
 
 
493 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2216  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  35.03 
 
 
463 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  35.37 
 
 
486 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  34.95 
 
 
486 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.96 
 
 
497 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  35.37 
 
 
486 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.04 
 
 
493 aa  230  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0703  mannitol dehydrogenase family protein  31.43 
 
 
463 aa  229  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.37 
 
 
486 aa  229  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  35.11 
 
 
486 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.99 
 
 
493 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  30.21 
 
 
488 aa  229  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  32.52 
 
 
492 aa  228  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  30.44 
 
 
488 aa  227  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  32.03 
 
 
488 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  35.11 
 
 
486 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0498  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.12 
 
 
469 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884765 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  32.03 
 
 
488 aa  226  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  31.46 
 
 
490 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.23 
 
 
488 aa  225  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  34.86 
 
 
486 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  30.23 
 
 
488 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.23 
 
 
488 aa  225  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  30.23 
 
 
488 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  30.23 
 
 
488 aa  225  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  34.86 
 
 
486 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.69 
 
 
493 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  30.59 
 
 
490 aa  223  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.52 
 
 
490 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  30.52 
 
 
490 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>