284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2216 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2216  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  100 
 
 
463 aa  960    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1922  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  99.35 
 
 
463 aa  953    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1812  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  99.78 
 
 
463 aa  958    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3238  Mannitol dehydrogenase domain  58.92 
 
 
470 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.794946  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0730  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  59.14 
 
 
470 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0498  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  59.65 
 
 
469 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884765 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1975  mannitol dehydrogenase-like  58.91 
 
 
464 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2585  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.91 
 
 
464 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0779102  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2609  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.7 
 
 
464 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566868  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5916  mannitol dehydrogenase  58.85 
 
 
464 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2504  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.39 
 
 
464 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  0.524531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2129  putative D-arabinitol dehydrogenase oxidoreductase protein  59.34 
 
 
465 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288509  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0703  mannitol dehydrogenase family protein  56.68 
 
 
463 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2633  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.17 
 
 
464 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0712  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.04 
 
 
464 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.466238 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1047  mannitol dehydrogenase family protein  56.47 
 
 
463 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0344  mannitol dehydrogenase family protein  56.47 
 
 
463 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0134  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.85 
 
 
465 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226672 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0643  mannitol dehydrogenase family protein  56.47 
 
 
480 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0783605  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2478  mannitol dehydrogenase family protein  56.47 
 
 
480 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.927953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0885  mannitol dehydrogenase family protein  56.47 
 
 
496 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0888  mannitol dehydrogenase family protein  56.47 
 
 
480 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0224596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0091  mannitol dehydrogenase family protein  56.47 
 
 
480 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000701131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1112  Mannitol dehydrogenase domain protein  56.82 
 
 
464 aa  511  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0894  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  54.41 
 
 
467 aa  494  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3167  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  55.27 
 
 
468 aa  484  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00309741  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5592  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  53.83 
 
 
474 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1090  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.05 
 
 
476 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  39.18 
 
 
491 aa  263  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.42 
 
 
491 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.31 
 
 
505 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  35.06 
 
 
497 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  32.37 
 
 
484 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  35.23 
 
 
503 aa  247  4e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.02 
 
 
494 aa  246  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  35.31 
 
 
497 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  37.13 
 
 
491 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  39.95 
 
 
492 aa  242  9e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  35.48 
 
 
493 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  37.57 
 
 
491 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  37.12 
 
 
491 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  38.08 
 
 
493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.18 
 
 
492 aa  234  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  33.94 
 
 
497 aa  233  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  33.63 
 
 
659 aa  232  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.01 
 
 
488 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3764  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.03 
 
 
495 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00857831  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  37.53 
 
 
486 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  36.41 
 
 
477 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  35.68 
 
 
500 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.41 
 
 
477 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  36.01 
 
 
490 aa  230  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  32 
 
 
472 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32 
 
 
472 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.78 
 
 
472 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  33.48 
 
 
494 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.37 
 
 
494 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.16 
 
 
506 aa  227  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  36.45 
 
 
506 aa  226  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  33.18 
 
 
589 aa  226  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  31.65 
 
 
493 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.47 
 
 
487 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  31.58 
 
 
502 aa  225  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  32.1 
 
 
493 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  34.91 
 
 
496 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  30.17 
 
 
492 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.8 
 
 
460 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.8 
 
 
460 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2666  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.04 
 
 
499 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.31 
 
 
493 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.69 
 
 
485 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  35.51 
 
 
451 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  30.58 
 
 
495 aa  212  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.91 
 
 
477 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  33.86 
 
 
485 aa  211  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  33.19 
 
 
509 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3727  mannitol dehydrogenase Rossman-like  33.19 
 
 
509 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4641  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  33.19 
 
 
509 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0969  mannitol dehydrogenase domain protein  34.32 
 
 
499 aa  210  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.124507 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  35.06 
 
 
455 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  31.16 
 
 
495 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.32 
 
 
484 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  34.96 
 
 
499 aa  207  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  34.49 
 
 
486 aa  206  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.49 
 
 
486 aa  206  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  34.49 
 
 
486 aa  206  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2907  mannitol dehydrogenase-like  34.3 
 
 
499 aa  206  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554349 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  31.79 
 
 
495 aa  206  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  33.33 
 
 
492 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  34.57 
 
 
464 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  34.22 
 
 
486 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4096  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.78 
 
 
488 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  34.22 
 
 
486 aa  204  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  34 
 
 
459 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  34.22 
 
 
486 aa  204  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  34.22 
 
 
486 aa  203  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  34.22 
 
 
486 aa  203  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.93 
 
 
493 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.67 
 
 
493 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.96 
 
 
493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>