288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2585 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2129  putative D-arabinitol dehydrogenase oxidoreductase protein  82.54 
 
 
465 aa  735    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288509  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0344  mannitol dehydrogenase family protein  82.9 
 
 
463 aa  748    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1047  mannitol dehydrogenase family protein  82.68 
 
 
463 aa  747    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5916  mannitol dehydrogenase  93.53 
 
 
464 aa  867    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0703  mannitol dehydrogenase family protein  82.68 
 
 
463 aa  767    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0730  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  73.43 
 
 
470 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1975  mannitol dehydrogenase-like  100 
 
 
464 aa  934    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2633  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  95.47 
 
 
464 aa  880    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2504  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  95.69 
 
 
464 aa  884    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  0.524531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0498  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  74.46 
 
 
469 aa  712    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884765 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2585  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
464 aa  934    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0779102  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3238  Mannitol dehydrogenase domain  71.92 
 
 
470 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.794946  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0643  mannitol dehydrogenase family protein  82.9 
 
 
480 aa  749    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0783605  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2478  mannitol dehydrogenase family protein  82.9 
 
 
480 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.927953  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0712  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  91.81 
 
 
464 aa  836    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.466238 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0885  mannitol dehydrogenase family protein  82.9 
 
 
496 aa  749    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0888  mannitol dehydrogenase family protein  82.9 
 
 
480 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0224596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0091  mannitol dehydrogenase family protein  82.9 
 
 
480 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000701131  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2609  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  98.92 
 
 
464 aa  927    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566868  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2216  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  58.79 
 
 
463 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1812  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  58.79 
 
 
463 aa  561  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1922  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  59 
 
 
463 aa  564  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0134  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  63.95 
 
 
465 aa  560  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1112  Mannitol dehydrogenase domain protein  64.19 
 
 
464 aa  550  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0894  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  59.91 
 
 
467 aa  542  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3167  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  59.08 
 
 
468 aa  504  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00309741  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5592  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.73 
 
 
474 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1090  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.23 
 
 
476 aa  317  4e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  42.63 
 
 
491 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.37 
 
 
491 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  42.51 
 
 
491 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  39.41 
 
 
497 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  42.25 
 
 
491 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  41.18 
 
 
491 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  39.22 
 
 
497 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  41.76 
 
 
493 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.33 
 
 
494 aa  259  7e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  40.43 
 
 
493 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  42.11 
 
 
503 aa  257  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.28 
 
 
505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  40 
 
 
490 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  39.91 
 
 
486 aa  252  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.18 
 
 
492 aa  252  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.65 
 
 
488 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  39.14 
 
 
492 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  31.73 
 
 
484 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.81 
 
 
477 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  38.81 
 
 
477 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  36.67 
 
 
497 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.49 
 
 
494 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  39.05 
 
 
496 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.11 
 
 
460 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.11 
 
 
460 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.74 
 
 
506 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.62 
 
 
477 aa  239  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.59 
 
 
472 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  35.14 
 
 
472 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.14 
 
 
472 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2907  mannitol dehydrogenase-like  38.73 
 
 
499 aa  236  5.0000000000000005e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0969  mannitol dehydrogenase domain protein  37.97 
 
 
499 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.124507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  39.49 
 
 
506 aa  234  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  39.23 
 
 
499 aa  233  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.33 
 
 
509 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3727  mannitol dehydrogenase Rossman-like  39.33 
 
 
509 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4641  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.33 
 
 
509 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  35.25 
 
 
500 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  33.56 
 
 
495 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  35.55 
 
 
493 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.08 
 
 
485 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  35.87 
 
 
493 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.7 
 
 
494 aa  229  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4096  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.58 
 
 
488 aa  228  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.21 
 
 
493 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.65 
 
 
659 aa  226  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  35.38 
 
 
492 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  36.02 
 
 
490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  36.24 
 
 
498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  40.15 
 
 
430 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.64 
 
 
528 aa  219  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.12 
 
 
487 aa  219  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  33.33 
 
 
589 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3764  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.04 
 
 
495 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00857831  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  39.49 
 
 
510 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.07 
 
 
493 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.69 
 
 
497 aa  216  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  33.56 
 
 
490 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  33.33 
 
 
490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  36.41 
 
 
488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  33.33 
 
 
490 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  39.84 
 
 
492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  31.44 
 
 
490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  36.41 
 
 
488 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  38.13 
 
 
451 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  34.42 
 
 
488 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2666  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.79 
 
 
499 aa  213  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  32.39 
 
 
502 aa  213  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  36.13 
 
 
488 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  33.11 
 
 
490 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  36.13 
 
 
488 aa  212  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.13 
 
 
488 aa  212  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>