More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0475 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0475  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHB)  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2826  MSHA pilin protein MshB  54.12 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  35.61 
 
 		 229 aa  130  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  34.43 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  43.54 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  41.03 
 
 		 202 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  41.18 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  40.51 
 
 		 218 aa  101  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  42.28 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  40.26 
 
 		 205 aa  98.6  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  40.26 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  40.26 
 
 		 205 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  40.26 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  39.61 
 
 		 205 aa  96.3  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  39.6 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  40.26 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  40.26 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  40.26 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  40.26 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  34.54 
 
 		 201 aa  93.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_002567  Pilin protein  35.27 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  32.99 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  31.96 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  32.47 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  31.96 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  31.05 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  29.79 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  26.34 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  29.17 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  28.57 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  25.49 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3316  methylation site containing protein  28.89 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  29.1 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  44.62 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  37.21 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  33.33 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  24.49 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  28.92 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  53.06 
 
 		 146 aa  62  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  53.33 
 
 		 168 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  43.94 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  29.1 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  47.92 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  37.66 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  50 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  36 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  51.06 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  53.19 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  37.68 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  35.94 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  26.42 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  48.89 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  44.68 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  51.06 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  32.32 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  46.81 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  44.68 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  44.68 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  51.06 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  44.68 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  54.35 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  47.92 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3268  hypothetical protein  53.33 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  47.92 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  48.89 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  44.44 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  36.36 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0759  hypothetical protein  32.12 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0153764  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  37.29 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  44.44 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  45.65 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  45.65 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  45.65 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  47.17 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  41.67 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  44.44 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  44.44 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  38.03 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  27.27 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  38.71 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3655  pilin, putative  32.11 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  44.44 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  45.83 
 
 		 126 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  31.08 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  32.39 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  52.38 
 
 		 131 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  42.59 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  26.9 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  38.71 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  50 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  41.3 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  43.4 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  35.38 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  29.2 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  29.2 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  48.84 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  39.68 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  30.4 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  32.63 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>