More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0901 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0901  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
362 aa  733    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.457949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2123  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  45.96 
 
 
364 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.44987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2179  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  45.96 
 
 
364 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2310  putrescine-binding periplasmic protein precursor  45.96 
 
 
364 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2276  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  46.39 
 
 
364 aa  309  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0107  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  46.22 
 
 
356 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26345  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1301  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  45.96 
 
 
364 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.803761  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1788  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  45.96 
 
 
364 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1672  extracellular solute-binding protein  45.96 
 
 
364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285778  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1058  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  45.96 
 
 
484 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2377  extracellular solute-binding protein family 1  43.09 
 
 
372 aa  306  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0307958  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1509  extracellular solute-binding protein  45.68 
 
 
364 aa  305  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1767  extracellular solute-binding protein  45.96 
 
 
364 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910155  normal  0.511303 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6328  extracellular solute-binding protein  45.68 
 
 
364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1751  extracellular solute-binding protein  45.68 
 
 
364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5050  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  45.4 
 
 
364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1675  extracellular solute-binding protein  45.4 
 
 
364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6345  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  45.95 
 
 
372 aa  299  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1950  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  44.17 
 
 
366 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17949  normal  0.9413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2309  extracellular solute-binding protein family 1  43.79 
 
 
366 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.0970832 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5362  extracellular solute-binding protein family 1  46.23 
 
 
366 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142467  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6065  extracellular solute-binding protein  46.01 
 
 
373 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2990  extracellular solute-binding protein  45.43 
 
 
371 aa  294  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840275  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7683  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  47.57 
 
 
373 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.370067 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1948  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  47.28 
 
 
373 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3043  extracellular solute-binding protein  43.77 
 
 
371 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2905  extracellular solute-binding protein  43.77 
 
 
371 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0940  ABC putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein PotF  45.35 
 
 
373 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147346  normal  0.325606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6638  extracellular solute-binding protein family 1  44.51 
 
 
372 aa  292  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2382  extracellular solute-binding protein  45.45 
 
 
371 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.721841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2996  extracellular solute-binding protein  45.45 
 
 
371 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03930  polyamine transport protein  43.26 
 
 
365 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1279  extracellular solute-binding protein  43.33 
 
 
366 aa  291  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2020  putrescine ABC transport system, binding exported protein  46.96 
 
 
373 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2862  extracellular solute-binding protein  42.61 
 
 
386 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6418  normal  0.0284463 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0634  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  46.96 
 
 
406 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820893  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3015  extracellular solute-binding protein  45.45 
 
 
371 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.946307  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0726  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  46.96 
 
 
409 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4758  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  45.29 
 
 
370 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263083  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4664  extracellular solute-binding protein family 1  45.05 
 
 
373 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.969317  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0392  polyamine transport protein  42.7 
 
 
365 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7525  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  45.6 
 
 
372 aa  288  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7565  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  46.86 
 
 
391 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132158  normal  0.536425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3929  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  41.57 
 
 
363 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46220  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  41.57 
 
 
363 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0209379  hitchhiker  0.00257917 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6181  extracellular solute-binding protein family 1  38.57 
 
 
369 aa  285  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48760  Polyamine transporter periplasmic protein PotF  42.43 
 
 
371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1903  polyamine ABC transporter system, substrate-binding protein  40.28 
 
 
376 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0765034  normal  0.376204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0407  extracellular solute-binding protein family 1  44.44 
 
 
365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000173672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1958  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  38.44 
 
 
369 aa  282  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1692  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  38.72 
 
 
369 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1698  extracellular solute-binding protein  41.97 
 
 
373 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1736  extracellular solute-binding protein  41.5 
 
 
375 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000683653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4865  extracellular solute-binding protein  42.35 
 
 
365 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0310  extracellular solute-binding protein  42.41 
 
 
364 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2287  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  38.72 
 
 
369 aa  279  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2386  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  37.88 
 
 
369 aa  278  7e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0352  extracellular solute-binding protein  41.57 
 
 
389 aa  278  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000218396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2828  extracellular solute-binding protein  44.97 
 
 
364 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5307  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  40.93 
 
 
365 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0123  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.97 
 
 
364 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0331  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  45.27 
 
 
364 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198037  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2117  extracellular solute-binding protein  41.48 
 
 
365 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.428561  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0140  extracellular solute-binding protein  45.27 
 
 
364 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0391  polyamine transport protein  39.13 
 
 
367 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03920  polyamine transport protein  39.13 
 
 
367 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.837862  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0124  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  45.27 
 
 
387 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1264  transcription factor jumonji, JmjC  40.45 
 
 
366 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1563  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  39 
 
 
369 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  39 
 
 
369 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  40.11 
 
 
366 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2730  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  39 
 
 
369 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0163  extracellular solute-binding protein  43.84 
 
 
365 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  40.11 
 
 
366 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0344  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 
365 aa  276  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.574749 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2331  extracellular solute-binding protein  44.67 
 
 
364 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2308  putrescine-binding periplasmic protein  44.67 
 
 
364 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2257  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.67 
 
 
364 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  40.11 
 
 
366 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0282  extracellular solute-binding protein  40.75 
 
 
365 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443093  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0346  extracellular solute-binding protein  41.46 
 
 
363 aa  275  7e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1368  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  39.04 
 
 
370 aa  275  8e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  39.67 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  39.67 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0345  extracellular solute-binding protein  41.76 
 
 
364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  39.84 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 
387 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1018  extracellular solute-binding protein  41.41 
 
 
369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5181  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  40.17 
 
 
365 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5088  extracellular solute-binding protein  40.17 
 
 
365 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.781791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5241  extracellular solute-binding protein  40.12 
 
 
365 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1341  extracellular solute-binding protein family 1  37.64 
 
 
369 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1010  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  38.76 
 
 
370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274464  normal  0.285031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5405  extracellular solute-binding protein  39.5 
 
 
370 aa  269  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.948456  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  40.11 
 
 
366 aa  269  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00859  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  38.76 
 
 
370 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0957  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  38.76 
 
 
370 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00865  hypothetical protein  38.76 
 
 
370 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2742  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  38.76 
 
 
370 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.602994  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3009  extracellular solute-binding protein  38.68 
 
 
366 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.274617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>