232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3507 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 429 aa  810    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  69.12 
 
 		 442 aa  478  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  62.56 
 
 		 434 aa  478  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  63.72 
 
 		 441 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  63.72 
 
 		 450 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  63.96 
 
 		 450 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  64.2 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  66.19 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  62.26 
 
 		 436 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  63.52 
 
 		 453 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.91 
 
 		 464 aa  458  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  64.99 
 
 		 437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  68.59 
 
 		 463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  62.78 
 
 		 451 aa  448  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  58.69 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  63.94 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.19 
 
 		 447 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.5 
 
 		 436 aa  433  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  59.9 
 
 		 434 aa  430  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  57.94 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.61 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.14 
 
 		 461 aa  408  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  49.28 
 
 		 422 aa  345  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  50.61 
 
 		 408 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  51.65 
 
 		 429 aa  335  7.999999999999999e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  48.92 
 
 		 414 aa  335  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  54.59 
 
 		 539 aa  327  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  48.4 
 
 		 433 aa  325  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  50.13 
 
 		 413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  54.4 
 
 		 431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  48.47 
 
 		 440 aa  300  4e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  47.64 
 
 		 401 aa  292  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  46.8 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  49.87 
 
 		 390 aa  290  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  50.48 
 
 		 442 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3091  Na+/H+ antiporter NhaA  54.74 
 
 		 447 aa  279  7e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.904983  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  50.53 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  42.75 
 
 		 396 aa  264  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.61 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  41.57 
 
 		 425 aa  256  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.58 
 
 		 389 aa  256  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  40 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.16 
 
 		 409 aa  256  6e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.41 
 
 		 391 aa  256  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  42.27 
 
 		 382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  38.68 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.49 
 
 		 391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.58 
 
 		 389 aa  253  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.16 
 
 		 389 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  42 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.42 
 
 		 391 aa  250  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.05 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.05 
 
 		 389 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  41.69 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.7 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.42 
 
 		 399 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.21 
 
 		 393 aa  246  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.53 
 
 		 382 aa  246  8e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  41.31 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  40.83 
 
 		 401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.65 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.88 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  38.66 
 
 		 383 aa  240  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  42.61 
 
 		 445 aa  240  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  43.44 
 
 		 404 aa  239  9e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  45 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.14 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.69 
 
 		 397 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.31 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.31 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.31 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.31 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.31 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.21 
 
 		 420 aa  236  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.95 
 
 		 389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.21 
 
 		 393 aa  236  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  37.24 
 
 		 391 aa  236  7e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.9 
 
 		 407 aa  236  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  45.23 
 
 		 390 aa  236  9e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.95 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.26 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.06 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1645  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.67 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  39.29 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4221  NhaA family transporter: sodium ion/proton  41.82 
 
 		 380 aa  234  3e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.1 
 
 		 391 aa  234  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0600  Na+/H+ antiporter NhaA  41.04 
 
 		 424 aa  233  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.82 
 
 		 395 aa  233  5e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.14 
 
 		 391 aa  233  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.17 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.17 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  43.17 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.17 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.17 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.17 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.17 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.31 
 
 		 394 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>