230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0925 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 436 aa  819    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  60.34 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  57.21 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  54.42 
 
 		 436 aa  358  9e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  51.93 
 
 		 446 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  52.7 
 
 		 462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  47.66 
 
 		 451 aa  323  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  49.01 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  49.38 
 
 		 453 aa  319  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.97 
 
 		 464 aa  316  6e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.77 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.25 
 
 		 436 aa  310  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.09 
 
 		 450 aa  309  8e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.09 
 
 		 441 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.09 
 
 		 450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  50.53 
 
 		 429 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  51.79 
 
 		 463 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  47.98 
 
 		 414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.95 
 
 		 447 aa  302  9e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  47.06 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  50.54 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  46.12 
 
 		 422 aa  299  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.78 
 
 		 442 aa  296  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  49.62 
 
 		 461 aa  292  8e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.72 
 
 		 449 aa  286  5e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  42.89 
 
 		 472 aa  286  5.999999999999999e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  47.83 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  48.42 
 
 		 401 aa  282  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  47.69 
 
 		 434 aa  279  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0869  putative Na+/H+ antiporter NhaA  41.22 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  45.32 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.95 
 
 		 461 aa  264  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  43.47 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  45.83 
 
 		 408 aa  260  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  46.72 
 
 		 413 aa  257  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  46.35 
 
 		 440 aa  246  6.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  51.4 
 
 		 431 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 		 539 aa  236  9e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  36.62 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  44.47 
 
 		 404 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3091  Na+/H+ antiporter NhaA  53.53 
 
 		 447 aa  231  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.904983  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.99 
 
 		 409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.9 
 
 		 401 aa  223  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.04 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  36.57 
 
 		 391 aa  223  7e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.21 
 
 		 392 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.16 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1645  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.46 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  36.1 
 
 		 396 aa  221  3e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.95 
 
 		 389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  36.6 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  35.57 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  37.76 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  36.34 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  38.63 
 
 		 455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  42.6 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.81 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  35.31 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.31 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.51 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.06 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.76 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.96 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.25 
 
 		 395 aa  210  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.37 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.63 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  36.39 
 
 		 424 aa  210  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.37 
 
 		 389 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.5 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.5 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.37 
 
 		 389 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.5 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.5 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.5 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  33.41 
 
 		 435 aa  209  9e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.25 
 
 		 399 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  35.49 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  40.82 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  35.35 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.82 
 
 		 388 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  40.82 
 
 		 388 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.82 
 
 		 388 aa  207  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  36.53 
 
 		 395 aa  207  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.38 
 
 		 388 aa  207  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.82 
 
 		 388 aa  207  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.82 
 
 		 388 aa  207  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.82 
 
 		 388 aa  207  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.82 
 
 		 388 aa  207  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  41.31 
 
 		 481 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.43 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  35.24 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1489  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.58 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.6 
 
 		 391 aa  205  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.85 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.81 
 
 		 382 aa  205  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.17 
 
 		 391 aa  203  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.85 
 
 		 389 aa  203  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.85 
 
 		 389 aa  203  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.01 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  35.9 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>