233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2583 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  100 
 
 		 442 aa  845    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  72.54 
 
 		 462 aa  559  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  68.68 
 
 		 434 aa  535  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  66.44 
 
 		 441 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  66.59 
 
 		 450 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  66.82 
 
 		 450 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  69.12 
 
 		 429 aa  512  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  72.71 
 
 		 463 aa  511  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  68.76 
 
 		 461 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  64.86 
 
 		 464 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  62.81 
 
 		 436 aa  495  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  64.68 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  62.7 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  68.01 
 
 		 437 aa  491  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  67.98 
 
 		 432 aa  488  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  63.53 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  64.98 
 
 		 436 aa  488  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  63.07 
 
 		 447 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  65.83 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  60.05 
 
 		 453 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.7 
 
 		 461 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  61.18 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  55.75 
 
 		 429 aa  360  4e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  50.61 
 
 		 414 aa  354  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 		 422 aa  353  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  54.4 
 
 		 539 aa  350  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  57.48 
 
 		 431 aa  346  5e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  49.76 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  51.36 
 
 		 408 aa  333  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  52.58 
 
 		 440 aa  326  6e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  50.72 
 
 		 413 aa  318  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  50.59 
 
 		 442 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  51.64 
 
 		 401 aa  316  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  46.08 
 
 		 402 aa  301  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3091  Na+/H+ antiporter NhaA  55.45 
 
 		 447 aa  296  6e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.904983  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  51.3 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  50.13 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  44.85 
 
 		 404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.35 
 
 		 409 aa  257  3e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  40 
 
 		 394 aa  253  7e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  40.31 
 
 		 383 aa  252  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.96 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  37.56 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.76 
 
 		 389 aa  248  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.3 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  40.24 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  41.34 
 
 		 382 aa  247  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.15 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.05 
 
 		 382 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.95 
 
 		 382 aa  245  9e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  40.76 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.58 
 
 		 391 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1645  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.66 
 
 		 389 aa  243  6e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.09 
 
 		 390 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  42.63 
 
 		 876 aa  240  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  42.6 
 
 		 445 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.56 
 
 		 391 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.05 
 
 		 389 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  41.16 
 
 		 396 aa  239  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  36.39 
 
 		 406 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.52 
 
 		 389 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.52 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.52 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.52 
 
 		 389 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  38.56 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.83 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  43.26 
 
 		 392 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  40 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.78 
 
 		 391 aa  235  9e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.15 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  41.16 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.31 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  37.34 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.54 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  38.3 
 
 		 438 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.21 
 
 		 393 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  39.63 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  39.43 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.94 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.79 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.48 
 
 		 391 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  39.33 
 
 		 455 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.58 
 
 		 391 aa  230  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  37.53 
 
 		 465 aa  230  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.07 
 
 		 398 aa  230  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.53 
 
 		 389 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  42.65 
 
 		 391 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  35.31 
 
 		 386 aa  229  8e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.09 
 
 		 399 aa  229  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.57 
 
 		 395 aa  229  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.6 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.6 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.6 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  39.36 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.6 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.6 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  40 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  38.85 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.87 
 
 		 394 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  37.5 
 
 		 470 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>