232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3924 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 402 aa  775    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  59.35 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  53.2 
 
 		 401 aa  349  5e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  48.97 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  47.07 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  46.84 
 
 		 433 aa  306  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  49 
 
 		 436 aa  302  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  46.62 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  46.68 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.26 
 
 		 436 aa  297  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.9 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.9 
 
 		 450 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  44.25 
 
 		 422 aa  290  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  44.1 
 
 		 413 aa  289  7e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.65 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  46.48 
 
 		 446 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  48.4 
 
 		 461 aa  286  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  44.42 
 
 		 414 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  46.8 
 
 		 429 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  46.26 
 
 		 463 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  46.07 
 
 		 462 aa  277  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.59 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  45.96 
 
 		 451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  45.52 
 
 		 453 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.55 
 
 		 449 aa  272  6e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.16 
 
 		 442 aa  272  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  43.67 
 
 		 429 aa  272  9e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  47.53 
 
 		 432 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.23 
 
 		 464 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  44.53 
 
 		 437 aa  266  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.87 
 
 		 461 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.75 
 
 		 394 aa  259  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.53 
 
 		 398 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.03 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  44.72 
 
 		 434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.15 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.18 
 
 		 389 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.35 
 
 		 391 aa  249  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.82 
 
 		 382 aa  249  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.18 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.18 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.18 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.66 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  47.86 
 
 		 431 aa  249  8e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.57 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.57 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.57 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.57 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.57 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  39.09 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  37.39 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  37.3 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  38.64 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  40.87 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.64 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  40 
 
 		 389 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.92 
 
 		 391 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  45.21 
 
 		 440 aa  245  9e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  38.14 
 
 		 383 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.51 
 
 		 389 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.51 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  40.72 
 
 		 408 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  35.83 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.26 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  41.71 
 
 		 396 aa  243  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  40.55 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  39.9 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.8 
 
 		 391 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  44.72 
 
 		 436 aa  239  9e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.05 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.65 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.9 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  39.64 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.65 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.65 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.64 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  40.1 
 
 		 388 aa  236  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.43 
 
 		 391 aa  235  8e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  37.53 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  39.75 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.21 
 
 		 391 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.66 
 
 		 409 aa  233  5e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  37.29 
 
 		 453 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.38 
 
 		 393 aa  232  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.92 
 
 		 391 aa  232  9e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  38.24 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.98 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.48 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  35.92 
 
 		 444 aa  230  3e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.58 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  39 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  40.72 
 
 		 401 aa  230  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  37.09 
 
 		 424 aa  229  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>