231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0476 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 408 aa  785    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  59 
 
 		 413 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  50.49 
 
 		 422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  50.53 
 
 		 401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  49.64 
 
 		 414 aa  350  2e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  54.34 
 
 		 390 aa  343  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  50.12 
 
 		 433 aa  342  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  50.63 
 
 		 434 aa  342  9e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  50.52 
 
 		 436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  50.13 
 
 		 453 aa  336  5e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  49.25 
 
 		 446 aa  332  6e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  51.3 
 
 		 462 aa  332  6e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  49.75 
 
 		 451 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.12 
 
 		 450 aa  328  8e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  50.61 
 
 		 429 aa  328  8e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.87 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  52.39 
 
 		 463 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.9 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.87 
 
 		 450 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  48.97 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.68 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  50.24 
 
 		 434 aa  319  6e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  50.77 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.18 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  49.88 
 
 		 461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.84 
 
 		 442 aa  300  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.24 
 
 		 464 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.89 
 
 		 447 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  50.13 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.65 
 
 		 461 aa  286  7e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  50.68 
 
 		 431 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  46.39 
 
 		 429 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  45.8 
 
 		 442 aa  259  7e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.21 
 
 		 391 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  41.67 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  38.7 
 
 		 386 aa  249  7e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.26 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  38.87 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.26 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.26 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.26 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.26 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.71 
 
 		 399 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  39.22 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.01 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.56 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.56 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  42.56 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.56 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.56 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.74 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.2 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.56 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.56 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.56 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.75 
 
 		 400 aa  243  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  42.48 
 
 		 388 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  43.12 
 
 		 392 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.86 
 
 		 392 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  39.89 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.3 
 
 		 407 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  41.94 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.94 
 
 		 394 aa  240  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.94 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  37.05 
 
 		 383 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.94 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  42.78 
 
 		 391 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  46.26 
 
 		 436 aa  239  9e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.46 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  40.4 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  36.89 
 
 		 455 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.83 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.57 
 
 		 394 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  38.3 
 
 		 396 aa  236  8e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.79 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.15 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.95 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  49.85 
 
 		 539 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  37.28 
 
 		 391 aa  234  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  44.27 
 
 		 440 aa  234  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  43.64 
 
 		 423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.76 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.76 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.76 
 
 		 389 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.76 
 
 		 389 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  38.71 
 
 		 453 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  35.16 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.21 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  35.16 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  42.65 
 
 		 408 aa  230  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.2 
 
 		 391 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  38.5 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  35.08 
 
 		 382 aa  229  8e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.37 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0600  Na+/H+ antiporter NhaA  40.1 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.7 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.93 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.38 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  38.63 
 
 		 453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  38 
 
 		 472 aa  226  6e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>