231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2476 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  100 
 
 		 464 aa  905    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  87.61 
 
 		 447 aa  705    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  73.17 
 
 		 450 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  73.54 
 
 		 441 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  72.95 
 
 		 450 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  65.23 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  66.05 
 
 		 462 aa  518  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  65.74 
 
 		 461 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.25 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  59.95 
 
 		 436 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  64.35 
 
 		 442 aa  476  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  65.13 
 
 		 437 aa  478  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  65.97 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  59.26 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.96 
 
 		 461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  62.53 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  62.59 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.94 
 
 		 436 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.04 
 
 		 436 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  60.37 
 
 		 429 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  54.39 
 
 		 453 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  54.01 
 
 		 451 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  49.44 
 
 		 422 aa  348  9e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  51.28 
 
 		 440 aa  347  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 		 414 aa  335  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  50.94 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  51.7 
 
 		 539 aa  332  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  55.23 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  50.25 
 
 		 401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  47.91 
 
 		 408 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  45.26 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  50.76 
 
 		 390 aa  296  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  49.51 
 
 		 442 aa  293  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  45.23 
 
 		 402 aa  288  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  48.97 
 
 		 436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  43.69 
 
 		 413 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  43.9 
 
 		 391 aa  259  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.84 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.89 
 
 		 399 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.16 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  43.83 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.36 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3091  Na+/H+ antiporter NhaA  54.22 
 
 		 447 aa  249  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.904983  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0869  putative Na+/H+ antiporter NhaA  38.65 
 
 		 419 aa  246  4e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  36.82 
 
 		 394 aa  247  4e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  41.13 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.79 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.56 
 
 		 390 aa  243  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.42 
 
 		 400 aa  243  7e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  42.64 
 
 		 445 aa  242  9e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  40.25 
 
 		 424 aa  242  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.75 
 
 		 382 aa  242  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.46 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  36.71 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  40.33 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.71 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  39.09 
 
 		 455 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.86 
 
 		 400 aa  240  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  38.36 
 
 		 383 aa  239  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.54 
 
 		 389 aa  239  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.92 
 
 		 409 aa  239  9e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.86 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.86 
 
 		 389 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.12 
 
 		 391 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.86 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.86 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.96 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  37.64 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  39.9 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.85 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  39.44 
 
 		 382 aa  237  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  38.44 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.32 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.8 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.06 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.89 
 
 		 397 aa  234  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.54 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.1 
 
 		 396 aa  232  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  43 
 
 		 391 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.58 
 
 		 399 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  41.61 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.72 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  41.84 
 
 		 413 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.74 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  38.92 
 
 		 401 aa  230  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.59 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.36 
 
 		 392 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.46 
 
 		 397 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  35.81 
 
 		 472 aa  229  9e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  36.51 
 
 		 438 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  36.94 
 
 		 470 aa  227  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  38.15 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  36.19 
 
 		 398 aa  226  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  40.1 
 
 		 465 aa  226  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.85 
 
 		 398 aa  226  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  40.99 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.56 
 
 		 392 aa  225  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.86 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  36.05 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  40 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>