More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2207 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 144 aa  293  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  80.56 
 
 		 144 aa  243  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  80.85 
 
 		 149 aa  239  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  78.29 
 
 		 149 aa  216  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  66.43 
 
 		 147 aa  207  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1702  3-dehydroquinate dehydratase, type II  68.79 
 
 		 145 aa  194  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17900  3-dehydroquinate dehydratase  70 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348774  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0610  3-dehydroquinate dehydratase  62.94 
 
 		 148 aa  190  7e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  66.91 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  64.49 
 
 		 146 aa  181  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  64.23 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0381  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.15 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  64.96 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1333  3-dehydroquinate dehydratase  65.03 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.736952  normal  0.590383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  63.5 
 
 		 145 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  63.5 
 
 		 145 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  63.5 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 		 161 aa  168  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3150  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.86 
 
 		 144 aa  166  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2415  3-dehydroquinate dehydratase  61.43 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491796  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  60.58 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12557  3-dehydroquinate dehydratase  57.97 
 
 		 147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000372311  normal  0.0899495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 145 aa  159  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3032  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  hitchhiker  0.000680386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 145 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 		 146 aa  155  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.7 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 152 aa  154  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 193 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 		 148 aa  154  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 145 aa  153  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 146 aa  153  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.59 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.17 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  56.3 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 		 147 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 176 aa  148  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 151 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 151 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 193 aa  146  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 193 aa  146  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 151 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 151 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.2 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  45.65 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  51.49 
 
 		 146 aa  141  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.1 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.65 
 
 		 144 aa  140  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 146 aa  140  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.86 
 
 		 142 aa  140  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 150 aa  139  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 153 aa  139  9e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  51.49 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 177 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  51.09 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>