More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2094 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 		 142 aa  298  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  65.93 
 
 		 148 aa  191  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  64.29 
 
 		 147 aa  191  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  61.87 
 
 		 152 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  64.66 
 
 		 146 aa  187  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  63.31 
 
 		 152 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  63.31 
 
 		 149 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  61.87 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  62.96 
 
 		 148 aa  183  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  62.14 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.27 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  58.99 
 
 		 151 aa  180  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  58.99 
 
 		 151 aa  180  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  58.99 
 
 		 151 aa  180  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  58.99 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 151 aa  176  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  56.3 
 
 		 152 aa  175  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  59.57 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  59.4 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  55.78 
 
 		 147 aa  174  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 		 148 aa  174  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 148 aa  173  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  53.96 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 176 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.4 
 
 		 156 aa  170  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 153 aa  170  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  58.65 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 151 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 		 150 aa  169  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 151 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 193 aa  168  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 151 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 151 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 151 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 		 151 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 160 aa  167  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 		 176 aa  167  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 193 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 193 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 149 aa  167  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  61.94 
 
 		 153 aa  167  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 151 aa  166  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  58.65 
 
 		 150 aa  166  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 193 aa  166  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  57.66 
 
 		 207 aa  166  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  58.82 
 
 		 162 aa  166  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.86 
 
 		 146 aa  166  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 207 aa  166  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  57.66 
 
 		 207 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  58.82 
 
 		 179 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  57.66 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.45 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  57.66 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 151 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  58.39 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  57.66 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  57.66 
 
 		 151 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 154 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  59.4 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 		 163 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  57.89 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  58.09 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 		 159 aa  161  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3150  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.22 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  58.65 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0546  3-dehydroquinate dehydratase  58.09 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>