More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3500 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 155 aa  312  9e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 145 aa  190  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 148 aa  189  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 145 aa  186  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  60.67 
 
 		 176 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  61.33 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  61.38 
 
 		 157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  61.76 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  60.81 
 
 		 148 aa  179  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  63.38 
 
 		 146 aa  179  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  60.81 
 
 		 148 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 145 aa  178  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  64.23 
 
 		 151 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.57 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  64.03 
 
 		 151 aa  174  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  64.03 
 
 		 151 aa  173  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  58.7 
 
 		 152 aa  172  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  63.31 
 
 		 191 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.87 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.04 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  59.85 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  64.44 
 
 		 145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  61.76 
 
 		 148 aa  170  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  56.62 
 
 		 150 aa  170  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 151 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  61.27 
 
 		 148 aa  169  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  58.22 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  66.42 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 		 151 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  59.59 
 
 		 193 aa  167  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  60.29 
 
 		 149 aa  167  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  61.59 
 
 		 149 aa  167  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 151 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 149 aa  167  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.71 
 
 		 144 aa  167  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  61.27 
 
 		 148 aa  167  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  60.58 
 
 		 193 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  60.58 
 
 		 193 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  59.85 
 
 		 193 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  58.22 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  59.33 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  60.58 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.94 
 
 		 144 aa  164  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 150 aa  163  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  57.82 
 
 		 154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  58.96 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 177 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  63.16 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  59.85 
 
 		 146 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  52.26 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.14 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  58.09 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 		 153 aa  155  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.1 
 
 		 165 aa  155  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.35 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  57.66 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 152 aa  153  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 149 aa  154  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 147 aa  153  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1633  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.97 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.47 
 
 		 146 aa  153  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 148 aa  150  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 		 156 aa  150  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 143 aa  150  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 148 aa  150  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>