More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5453 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 147 aa  300  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  75.18 
 
 		 149 aa  221  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  70.63 
 
 		 144 aa  205  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  68.53 
 
 		 147 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  68.31 
 
 		 146 aa  201  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  67.83 
 
 		 147 aa  200  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  65.19 
 
 		 149 aa  184  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  61.15 
 
 		 146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  60.99 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  61.7 
 
 		 151 aa  180  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  60.99 
 
 		 151 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 		 193 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 193 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 193 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 193 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  58.7 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  58.99 
 
 		 152 aa  177  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  62.22 
 
 		 160 aa  177  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  61.48 
 
 		 151 aa  177  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 151 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  62.04 
 
 		 152 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  63.5 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  62.77 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  62.77 
 
 		 152 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.48 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 147 aa  166  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 154 aa  164  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.88 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  52.7 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  58.39 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  62.04 
 
 		 143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.52 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 153 aa  160  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5704  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 146 aa  159  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  55.15 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 176 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 148 aa  157  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  52.41 
 
 		 146 aa  156  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  59.4 
 
 		 149 aa  156  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.17 
 
 		 145 aa  156  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.74 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  53.74 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  54.96 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  56.34 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  55.15 
 
 		 153 aa  155  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 179 aa  154  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2054  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5950  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375239  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.68 
 
 		 165 aa  153  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  55.73 
 
 		 150 aa  153  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 151 aa  153  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  56.3 
 
 		 150 aa  153  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 151 aa  153  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  54.89 
 
 		 146 aa  153  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 147 aa  153  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 147 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  54.42 
 
 		 148 aa  151  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 151 aa  151  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.55 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1784  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 151 aa  151  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 		 176 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 		 157 aa  150  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 156 aa  150  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 158 aa  150  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 151 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 156 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  52.41 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  51.11 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 177 aa  149  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2337  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.17 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.29 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>