More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03030 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  84.46 
 
 		 148 aa  261  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  70.34 
 
 		 147 aa  214  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  71.72 
 
 		 146 aa  215  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  66.89 
 
 		 152 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  66.9 
 
 		 149 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  66.22 
 
 		 149 aa  209  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  66.22 
 
 		 152 aa  209  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  64.79 
 
 		 146 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  64.96 
 
 		 193 aa  187  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  64.08 
 
 		 160 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  63.19 
 
 		 149 aa  186  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.96 
 
 		 142 aa  183  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  61.81 
 
 		 151 aa  183  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  61.81 
 
 		 151 aa  183  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  63.77 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  63.12 
 
 		 153 aa  181  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  60.42 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  60.42 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  61.11 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  60.42 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  63.5 
 
 		 193 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  63.5 
 
 		 193 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  62.77 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  63.5 
 
 		 151 aa  180  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  63.5 
 
 		 151 aa  180  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  63.5 
 
 		 151 aa  180  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  63.5 
 
 		 151 aa  180  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 152 aa  180  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  62.77 
 
 		 193 aa  180  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  58.7 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5950  3-dehydroquinate dehydratase  56.46 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375239  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 176 aa  174  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  56.46 
 
 		 148 aa  174  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  55.78 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  55.7 
 
 		 151 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  56.46 
 
 		 148 aa  173  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  59.71 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  59.85 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  56.2 
 
 		 145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  62.69 
 
 		 150 aa  170  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  59.12 
 
 		 147 aa  169  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 149 aa  169  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  61.27 
 
 		 155 aa  169  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 145 aa  169  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  59.12 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 		 157 aa  167  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  52.38 
 
 		 156 aa  167  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 		 176 aa  168  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.27 
 
 		 144 aa  167  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  51.72 
 
 		 153 aa  167  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  63.04 
 
 		 162 aa  167  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  60.27 
 
 		 151 aa  166  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 		 147 aa  166  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 147 aa  166  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  58.96 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 147 aa  166  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  52.35 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  52.35 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.9 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  58.9 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.55 
 
 		 148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  59.59 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  59.59 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  57.82 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 179 aa  164  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  58.21 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  52.7 
 
 		 150 aa  164  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  59.59 
 
 		 151 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  52.41 
 
 		 163 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  58.22 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 158 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  63.04 
 
 		 162 aa  163  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  54.93 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 153 aa  161  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.15 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  52.32 
 
 		 159 aa  161  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  52.35 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  58.09 
 
 		 146 aa  161  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  57.89 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 		 177 aa  161  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  57.97 
 
 		 145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.71 
 
 		 149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>