More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3425 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 151 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  98.68 
 
 		 151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  93.29 
 
 		 154 aa  293  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  90.07 
 
 		 150 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  90.07 
 
 		 150 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  90.07 
 
 		 150 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  88.74 
 
 		 150 aa  277  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  88.74 
 
 		 207 aa  278  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  88.08 
 
 		 150 aa  276  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  88.08 
 
 		 150 aa  276  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  88.08 
 
 		 207 aa  274  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  88.08 
 
 		 207 aa  274  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  88.08 
 
 		 150 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  88.08 
 
 		 150 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  88.08 
 
 		 150 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  88.08 
 
 		 150 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  88.08 
 
 		 150 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3689  3-dehydroquinate dehydratase  89.4 
 
 		 150 aa  261  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  76.87 
 
 		 162 aa  240  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  72.22 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  73.43 
 
 		 155 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  73.43 
 
 		 155 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  79.14 
 
 		 162 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  74.47 
 
 		 148 aa  217  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  70.47 
 
 		 150 aa  214  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  70.47 
 
 		 150 aa  214  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  73.38 
 
 		 141 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  68.06 
 
 		 149 aa  205  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  68.92 
 
 		 151 aa  203  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  68 
 
 		 151 aa  203  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  68.92 
 
 		 151 aa  203  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  68.92 
 
 		 151 aa  202  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  67.57 
 
 		 150 aa  200  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  67.81 
 
 		 148 aa  199  8e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  68.75 
 
 		 147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  68.75 
 
 		 147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  66.21 
 
 		 148 aa  197  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  65.28 
 
 		 146 aa  196  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  66.67 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  64.14 
 
 		 145 aa  194  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  63.83 
 
 		 149 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  66.2 
 
 		 150 aa  191  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  63.45 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  60.56 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  66.19 
 
 		 172 aa  188  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  63.45 
 
 		 179 aa  187  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  64.79 
 
 		 149 aa  187  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  64.44 
 
 		 153 aa  184  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0032  3-dehydroquinate dehydratase  65.75 
 
 		 148 aa  184  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  62.86 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  65.28 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0040  3-dehydroquinate dehydratase  65.75 
 
 		 244 aa  183  6e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  59.59 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1053  3-dehydroquinate dehydratase  61.81 
 
 		 147 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000105156  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  62.07 
 
 		 150 aa  180  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 152 aa  180  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 		 150 aa  180  7e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4088  3-dehydroquinate dehydratase  59.46 
 
 		 151 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2337  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.81 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 145 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0546  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 149 aa  176  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  60.27 
 
 		 149 aa  176  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0534  3-dehydroquinate dehydratase  59.31 
 
 		 148 aa  176  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000293709  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 151 aa  173  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.97 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0768  3-dehydroquinate dehydratase  57.53 
 
 		 167 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000317323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3363  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.72 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62322  3-dehydroquinate dehydratase 1 (3-dehydroquinase 1) (Type II DHQase 1)  54.86 
 
 		 146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 144 aa  170  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 144 aa  170  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3593  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 148 aa  170  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 178 aa  170  5.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 161 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 144 aa  169  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 		 149 aa  168  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1476  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 178 aa  168  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657033  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  56.85 
 
 		 146 aa  167  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.87 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 149 aa  167  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  57.53 
 
 		 158 aa  166  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 		 144 aa  166  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  61.48 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  55.48 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  58.82 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 		 148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.66 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  58.57 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4416  3-dehydroquinate dehydratase  63.57 
 
 		 150 aa  163  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0161291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0393  3-dehydroquinate dehydratase  63.64 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0460  3-dehydroquinate dehydratase  63.64 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480459  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1203  3-dehydroquinate dehydratase  63.64 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.26523  normal  0.802728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  56.55 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0255  3-dehydroquinate dehydratase  61.36 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.908365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>