More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3419 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
151 aa  308  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  90.07 
 
 
151 aa  288  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  88.74 
 
 
151 aa  286  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  88.74 
 
 
151 aa  286  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  88.74 
 
 
151 aa  286  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  88.74 
 
 
151 aa  286  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  87.42 
 
 
151 aa  282  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  73.51 
 
 
193 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  73.51 
 
 
193 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  72.19 
 
 
193 aa  235  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  72.85 
 
 
151 aa  234  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  72.85 
 
 
151 aa  234  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  72.85 
 
 
151 aa  234  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  72.85 
 
 
151 aa  234  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  72.19 
 
 
193 aa  234  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  72.85 
 
 
151 aa  229  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  72.85 
 
 
160 aa  224  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  65 
 
 
149 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  63.31 
 
 
146 aa  184  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  60.99 
 
 
147 aa  181  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  62.77 
 
 
148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  63.04 
 
 
148 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.99 
 
 
142 aa  179  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  62.86 
 
 
146 aa  179  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  59.71 
 
 
145 aa  179  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  64.54 
 
 
149 aa  178  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  60.81 
 
 
149 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  60.81 
 
 
152 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  61.11 
 
 
147 aa  177  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 
149 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 
148 aa  176  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 
176 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 
149 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  58.11 
 
 
152 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.28 
 
 
144 aa  174  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 
150 aa  173  8e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 
147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.24 
 
 
145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 
145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  59.85 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  56.72 
 
 
152 aa  171  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  55.48 
 
 
150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 
147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 
158 aa  170  6.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  56.46 
 
 
146 aa  169  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  57.78 
 
 
161 aa  169  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  52.38 
 
 
150 aa  168  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 
147 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  57.82 
 
 
148 aa  168  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 
145 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  58.62 
 
 
153 aa  168  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  57.82 
 
 
148 aa  167  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 
145 aa  167  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  55.48 
 
 
148 aa  167  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  62.22 
 
 
148 aa  167  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  54.05 
 
 
150 aa  167  6e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.94 
 
 
148 aa  166  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 
157 aa  165  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 
176 aa  165  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  56.38 
 
 
149 aa  164  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 
158 aa  163  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2054  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 
151 aa  163  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  58.52 
 
 
156 aa  163  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  56.2 
 
 
153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5950  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 
149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375239  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  56.76 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  56.76 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 
151 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  58.09 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  56.76 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  56.76 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 
153 aa  161  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  55.41 
 
 
207 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  55.41 
 
 
150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  55.1 
 
 
156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  55.41 
 
 
150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 
147 aa  160  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  58.39 
 
 
179 aa  160  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 
143 aa  160  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  58.52 
 
 
146 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.78 
 
 
149 aa  160  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  58.52 
 
 
146 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1784  3-dehydroquinate dehydratase  54.42 
 
 
147 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  54.68 
 
 
146 aa  160  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60 
 
 
146 aa  160  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  59.12 
 
 
149 aa  159  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 
154 aa  159  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 
153 aa  159  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  58.09 
 
 
146 aa  159  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  59.56 
 
 
145 aa  159  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  58.62 
 
 
151 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  58.09 
 
 
144 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  58.09 
 
 
144 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  58.62 
 
 
151 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  62.32 
 
 
162 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 
150 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  58.09 
 
 
144 aa  158  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 
150 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  58.09 
 
 
146 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>