More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0849 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
151 aa  308  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
151 aa  308  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
151 aa  308  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  99.34 
 
 
193 aa  308  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
151 aa  308  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  99.34 
 
 
193 aa  307  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  99.34 
 
 
193 aa  307  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  92.05 
 
 
193 aa  288  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  75.5 
 
 
151 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  76.16 
 
 
151 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  75.5 
 
 
151 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  75.5 
 
 
151 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  74.83 
 
 
151 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  74.17 
 
 
151 aa  236  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  72.85 
 
 
151 aa  234  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  73.79 
 
 
160 aa  224  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  70.2 
 
 
151 aa  224  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  66.43 
 
 
149 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  64.34 
 
 
149 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  64.34 
 
 
152 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  63.64 
 
 
149 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 
146 aa  184  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  61.27 
 
 
147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  64.03 
 
 
145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  62.24 
 
 
152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  62.68 
 
 
146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  60.56 
 
 
147 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  58.39 
 
 
158 aa  180  6e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  63.5 
 
 
148 aa  180  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.54 
 
 
144 aa  180  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  63.27 
 
 
149 aa  179  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  62.59 
 
 
148 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 
147 aa  179  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  62.14 
 
 
147 aa  175  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 
152 aa  174  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  59.71 
 
 
176 aa  174  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  61.43 
 
 
150 aa  174  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  58.99 
 
 
146 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  58.78 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  60.43 
 
 
157 aa  170  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  56.29 
 
 
149 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  60.43 
 
 
176 aa  170  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.52 
 
 
149 aa  169  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.04 
 
 
156 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 
145 aa  168  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.12 
 
 
142 aa  167  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  57.78 
 
 
161 aa  168  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 
148 aa  167  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  56.76 
 
 
149 aa  167  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 
148 aa  167  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 
145 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 
155 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 
148 aa  165  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.94 
 
 
146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 
146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 
150 aa  164  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 
151 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2054  3-dehydroquinate dehydratase  52.32 
 
 
151 aa  164  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  58.7 
 
 
156 aa  163  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 
150 aa  163  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.55 
 
 
148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 
177 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 
147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  56.39 
 
 
150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 
156 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 
147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  56.62 
 
 
153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 
148 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 
145 aa  158  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 
156 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  58.02 
 
 
145 aa  157  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.57 
 
 
145 aa  157  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 
158 aa  157  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 
153 aa  157  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5950  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
149 aa  156  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375239  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  56.62 
 
 
150 aa  156  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.78 
 
 
146 aa  156  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 
151 aa  156  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5704  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 
146 aa  156  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858708  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 
150 aa  156  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 
163 aa  155  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.03 
 
 
144 aa  155  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  55.03 
 
 
159 aa  156  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  57.78 
 
 
146 aa  155  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 
151 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1784  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 
147 aa  156  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  56.62 
 
 
179 aa  156  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  61.48 
 
 
162 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 
153 aa  155  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 
151 aa  154  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 
151 aa  154  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 
149 aa  154  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 
146 aa  154  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  56.62 
 
 
149 aa  154  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0534  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 
148 aa  154  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000293709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 
143 aa  154  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 
151 aa  153  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.42 
 
 
150 aa  153  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 
150 aa  153  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  57.78 
 
 
150 aa  153  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>