More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3464 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
207 aa  309  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
207 aa  309  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
150 aa  306  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
150 aa  306  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
150 aa  306  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
150 aa  306  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
150 aa  306  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  98.67 
 
 
207 aa  304  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  93.33 
 
 
150 aa  287  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  93.33 
 
 
150 aa  287  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  93.33 
 
 
150 aa  287  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  91.33 
 
 
150 aa  283  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  90.67 
 
 
150 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  90.67 
 
 
150 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  88.08 
 
 
151 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  88.08 
 
 
151 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  90.28 
 
 
154 aa  269  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3689  3-dehydroquinate dehydratase  91.33 
 
 
150 aa  260  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  77.03 
 
 
162 aa  242  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  73.43 
 
 
156 aa  226  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  71.23 
 
 
155 aa  222  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  71.23 
 
 
155 aa  221  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  74.83 
 
 
148 aa  217  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  70.75 
 
 
149 aa  216  8.999999999999998e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  74.32 
 
 
162 aa  216  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  74.82 
 
 
141 aa  215  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  68.97 
 
 
148 aa  206  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  67.11 
 
 
150 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  67.11 
 
 
150 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  68.97 
 
 
151 aa  202  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  68.28 
 
 
147 aa  200  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  68.28 
 
 
147 aa  200  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  68.75 
 
 
151 aa  200  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  68.75 
 
 
151 aa  200  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  67.12 
 
 
148 aa  200  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  68.75 
 
 
151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  66.43 
 
 
172 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  67.36 
 
 
150 aa  197  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  65.52 
 
 
147 aa  196  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  63.38 
 
 
149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.45 
 
 
145 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.45 
 
 
146 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  66.21 
 
 
145 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  63.45 
 
 
149 aa  187  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 
149 aa  187  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  62.14 
 
 
151 aa  186  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0032  3-dehydroquinate dehydratase  65.97 
 
 
148 aa  186  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  63.45 
 
 
179 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  63.38 
 
 
150 aa  185  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0040  3-dehydroquinate dehydratase  65.97 
 
 
244 aa  185  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1053  3-dehydroquinate dehydratase  60.42 
 
 
147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000105156  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  60.42 
 
 
152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  62.5 
 
 
153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2337  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.27 
 
 
148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  59.59 
 
 
146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  58.62 
 
 
145 aa  181  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0546  3-dehydroquinate dehydratase  59.59 
 
 
149 aa  181  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  63.01 
 
 
150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 
150 aa  180  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  57.93 
 
 
145 aa  180  7e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0768  3-dehydroquinate dehydratase  60.27 
 
 
167 aa  177  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000317323  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0534  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 
148 aa  176  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000293709  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.42 
 
 
149 aa  176  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4088  3-dehydroquinate dehydratase  57.53 
 
 
151 aa  175  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62322  3-dehydroquinate dehydratase 1 (3-dehydroquinase 1) (Type II DHQase 1)  55.56 
 
 
146 aa  175  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  58.9 
 
 
151 aa  175  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 
144 aa  173  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3363  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.9 
 
 
150 aa  173  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  59.31 
 
 
149 aa  173  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  60.42 
 
 
149 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 
144 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 
144 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3593  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 
148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  57.53 
 
 
146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.03 
 
 
144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 
149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 
144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.11 
 
 
184 aa  170  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 
148 aa  168  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 
156 aa  168  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  60 
 
 
146 aa  167  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0376  3-dehydroquinate dehydratase  62.22 
 
 
153 aa  167  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.071732  normal  0.0167457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0197  3-dehydroquinate dehydratase  62.22 
 
 
153 aa  167  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 
150 aa  167  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  57.97 
 
 
161 aa  167  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.14 
 
 
142 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 
157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  58.09 
 
 
143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 
146 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  61.07 
 
 
144 aa  164  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 
146 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 
146 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 
146 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  59.12 
 
 
150 aa  163  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 
178 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  59.33 
 
 
148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1476  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 
178 aa  161  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657033  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  53.74 
 
 
149 aa  159  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 
147 aa  158  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>