More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5252 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 146 aa  297  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  71.83 
 
 		 143 aa  209  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  72.34 
 
 		 143 aa  206  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  72.34 
 
 		 143 aa  204  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  71.64 
 
 		 145 aa  201  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  71.64 
 
 		 145 aa  201  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  71.64 
 
 		 145 aa  200  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  64.38 
 
 		 146 aa  197  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3150  3-dehydroquinate dehydratase, type II  68.84 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12557  3-dehydroquinate dehydratase  66.43 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000372311  normal  0.0899495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  65.94 
 
 		 145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  64.49 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  64.49 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  64.93 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  62.77 
 
 		 147 aa  177  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2415  3-dehydroquinate dehydratase  65.19 
 
 		 146 aa  176  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491796  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  60.31 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 		 146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 148 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.89 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0610  3-dehydroquinate dehydratase  58.39 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  57.35 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.71 
 
 		 156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1702  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.75 
 
 		 145 aa  159  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.97 
 
 		 144 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17900  3-dehydroquinate dehydratase  61.03 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348774  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.63 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 149 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 149 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 151 aa  153  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.96 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0381  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.2 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  52.63 
 
 		 149 aa  151  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 193 aa  150  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.45 
 
 		 165 aa  150  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 145 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1333  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 		 141 aa  150  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.736952  normal  0.590383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3032  3-dehydroquinate dehydratase  56.2 
 
 		 145 aa  150  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  hitchhiker  0.000680386 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 151 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 151 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 151 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 193 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 151 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 193 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 193 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 176 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 150 aa  147  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 150 aa  147  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  51.49 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  146  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 150 aa  146  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 150 aa  146  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  146  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 150 aa  146  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 207 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 207 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 207 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.72 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 		 176 aa  144  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  48.51 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 		 157 aa  143  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  48.89 
 
 		 145 aa  143  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 158 aa  143  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>