More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0849 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 142 aa  285  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  73.57 
 
 		 142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  71.22 
 
 		 145 aa  202  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  62.86 
 
 		 146 aa  180  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 		 159 aa  177  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  57.97 
 
 		 150 aa  176  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.69 
 
 		 160 aa  174  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  62.77 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  62.77 
 
 		 144 aa  174  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 		 146 aa  174  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.09 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 		 146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.7 
 
 		 145 aa  169  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  58.82 
 
 		 148 aa  169  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 		 146 aa  169  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  56.62 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 159 aa  168  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 159 aa  168  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 160 aa  167  5e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 159 aa  166  8e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  56.2 
 
 		 152 aa  166  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  56.2 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  57.97 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.86 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  56.2 
 
 		 145 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 		 148 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 144 aa  163  8e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 144 aa  163  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 		 149 aa  163  9e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  58.39 
 
 		 145 aa  163  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.93 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  59.26 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.56 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 161 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 		 148 aa  159  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  51.88 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.8 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.62 
 
 		 150 aa  159  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  57.35 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  57.35 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 160 aa  158  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.35 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 		 160 aa  157  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  56.43 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 146 aa  157  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 		 150 aa  156  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.07 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 144 aa  155  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.35 
 
 		 184 aa  155  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  54.14 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  54.14 
 
 		 152 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  55.97 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.59 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  52.17 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1198  3-dehydroquinate dehydratase  55.64 
 
 		 141 aa  154  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1521  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 148 aa  153  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  54.14 
 
 		 146 aa  153  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 151 aa  153  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.88 
 
 		 147 aa  153  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 145 aa  153  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.74 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2367  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.58 
 
 		 144 aa  150  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0207637  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 145 aa  150  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 162 aa  150  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  54.89 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 191 aa  150  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.73 
 
 		 137 aa  150  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 		 142 aa  149  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>