More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1505 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  82.8 
 
 
159 aa  271  4.0000000000000004e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  79.11 
 
 
159 aa  269  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  79.33 
 
 
155 aa  252  1.0000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  76.47 
 
 
159 aa  249  9.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  76.47 
 
 
159 aa  249  9.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  75.82 
 
 
159 aa  248  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  77.24 
 
 
160 aa  246  9e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  74.5 
 
 
160 aa  239  1e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  69.93 
 
 
160 aa  229  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 
144 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 
142 aa  177  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  52.74 
 
 
150 aa  176  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  52.74 
 
 
150 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.68 
 
 
152 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
147 aa  168  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.64 
 
 
145 aa  168  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 
146 aa  167  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
146 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
146 aa  165  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
146 aa  165  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
146 aa  165  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
146 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 
146 aa  165  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 
145 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
146 aa  165  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  46 
 
 
150 aa  166  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
146 aa  165  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.63 
 
 
144 aa  164  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 
142 aa  163  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
146 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 
153 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
146 aa  161  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 
153 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.94 
 
 
145 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 
144 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 
144 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 
148 aa  160  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 
152 aa  159  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.95 
 
 
148 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.98 
 
 
152 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.75 
 
 
147 aa  157  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
149 aa  157  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  46.53 
 
 
147 aa  157  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.52 
 
 
137 aa  156  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.59 
 
 
145 aa  156  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
149 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 
146 aa  154  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 
145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 
144 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 
149 aa  152  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  56.62 
 
 
145 aa  152  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
149 aa  153  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 
148 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 
144 aa  152  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.17 
 
 
149 aa  153  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
145 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 
145 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.35 
 
 
184 aa  152  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 
148 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  48.99 
 
 
157 aa  151  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 
149 aa  151  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 
150 aa  151  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 
151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.38 
 
 
142 aa  149  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 
144 aa  149  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 
147 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  51.15 
 
 
144 aa  149  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.39 
 
 
165 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 
162 aa  148  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 
145 aa  148  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.83 
 
 
150 aa  148  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 
145 aa  148  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 
166 aa  147  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 
146 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  43.92 
 
 
156 aa  147  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 
147 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  43.24 
 
 
149 aa  147  8e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 
152 aa  147  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  44 
 
 
150 aa  147  8e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  42.47 
 
 
146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  42.28 
 
 
150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  50.77 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1521  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.08 
 
 
137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  43.15 
 
 
151 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  44.59 
 
 
176 aa  144  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  47.3 
 
 
151 aa  144  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 
148 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  45.33 
 
 
151 aa  143  8.000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>