More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0571 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 144 aa  294  3e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 144 aa  294  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1198  3-dehydroquinate dehydratase  64.75 
 
 		 141 aa  200  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.74 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.1 
 
 		 160 aa  167  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 		 146 aa  166  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  58.65 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 		 146 aa  163  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.4 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 159 aa  160  4.0000000000000004e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 146 aa  160  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 146 aa  159  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.03 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.2 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 156 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 159 aa  149  8.999999999999999e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2367  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.64 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0207637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  48.15 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1521  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 148 aa  147  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0209  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306548 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.35 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 		 145 aa  144  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.64 
 
 		 137 aa  143  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0417  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  48.15 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2360  3-dehydroquinate dehydratase  51.91 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.896861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.9 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.64 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5767  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.533207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  46.1 
 
 		 144 aa  140  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.22 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  45.14 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  47.97 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  48.09 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.89 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4497  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81741  normal  0.381959 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 150 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 207 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 207 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 147 aa  137  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.95 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  46.53 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 150 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 150 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 150 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 150 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 150 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 207 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3003  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216438  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.48 
 
 		 145 aa  133  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 		 145 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  47.26 
 
 		 149 aa  133  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 162 aa  133  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.48 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>