More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1924 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 142 aa  290  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  73.57 
 
 		 142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  66.91 
 
 		 145 aa  192  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  58.7 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.61 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 		 145 aa  173  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.27 
 
 		 145 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  58.39 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 147 aa  167  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  54.89 
 
 		 150 aa  166  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 146 aa  163  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 146 aa  163  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 159 aa  163  8e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  55.64 
 
 		 152 aa  163  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 144 aa  163  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.62 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  55.64 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  55.64 
 
 		 152 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 148 aa  160  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  55.64 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.52 
 
 		 148 aa  160  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 146 aa  160  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 		 150 aa  159  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 		 159 aa  157  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 		 145 aa  157  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.97 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 150 aa  156  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.08 
 
 		 150 aa  157  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 149 aa  156  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 159 aa  155  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.8 
 
 		 152 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2367  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.7 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0207637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  48.89 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 149 aa  153  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  55.15 
 
 		 160 aa  153  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.48 
 
 		 155 aa  153  8e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 		 144 aa  153  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 159 aa  153  9e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 173 aa  152  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  51.88 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 		 144 aa  150  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 		 144 aa  150  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.41 
 
 		 147 aa  150  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 191 aa  148  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.75 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2360  3-dehydroquinate dehydratase  55.22 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.896861  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.94 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  50.7 
 
 		 153 aa  147  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.23 
 
 		 149 aa  146  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 151 aa  146  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5767  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.533207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.48 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  48.12 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  52.27 
 
 		 145 aa  144  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>