More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3469 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 		 152 aa  308  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  78.32 
 
 		 153 aa  225  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  78.32 
 
 		 153 aa  225  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  69.13 
 
 		 150 aa  214  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  72.41 
 
 		 149 aa  213  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  71.92 
 
 		 150 aa  212  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  64.58 
 
 		 152 aa  199  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  65.28 
 
 		 149 aa  191  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  63.64 
 
 		 150 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  60.56 
 
 		 144 aa  176  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  60.56 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.15 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  60.56 
 
 		 149 aa  173  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  58.09 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 146 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 		 145 aa  163  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 		 158 aa  163  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.94 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  59.56 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.64 
 
 		 184 aa  161  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 146 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 146 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 146 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 146 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 146 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 151 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 146 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  56.3 
 
 		 156 aa  159  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.23 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 		 163 aa  158  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  54.68 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  50.65 
 
 		 159 aa  157  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  58.96 
 
 		 148 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 		 150 aa  156  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.86 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  57.69 
 
 		 144 aa  155  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  48.05 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  52 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 191 aa  154  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.34 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  55.03 
 
 		 153 aa  153  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.66 
 
 		 160 aa  153  9e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.73 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.25 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0383  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  51.02 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  56.55 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  51.02 
 
 		 176 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  57.78 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  54.62 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03831  3-dehydroquinate dehydratase  58.14 
 
 		 148 aa  150  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  51.02 
 
 		 157 aa  151  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.38 
 
 		 149 aa  151  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  52.63 
 
 		 144 aa  150  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  58.09 
 
 		 162 aa  150  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  53.69 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1833  3-dehydroquinate dehydratase  58.14 
 
 		 146 aa  150  7e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.120538  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0502  3-dehydroquinate dehydratase  55.81 
 
 		 146 aa  150  7e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0028378  normal  0.126583 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 145 aa  150  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  52.74 
 
 		 151 aa  150  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  51.7 
 
 		 176 aa  150  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  55.22 
 
 		 148 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  58.96 
 
 		 172 aa  149  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  58.09 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  54 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  53.42 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>