More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0370 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
159 aa  323  5e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  90.45 
 
 
159 aa  301  2.0000000000000002e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  82.8 
 
 
159 aa  271  4.0000000000000004e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  75.48 
 
 
159 aa  253  6e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  75.48 
 
 
159 aa  253  6e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  74.84 
 
 
159 aa  252  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  75.48 
 
 
155 aa  248  2e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  75.17 
 
 
160 aa  243  4.9999999999999997e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  75.17 
 
 
160 aa  236  1e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  70.32 
 
 
160 aa  229  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 
150 aa  185  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 
144 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 
150 aa  177  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.05 
 
 
144 aa  171  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.38 
 
 
152 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 
145 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
147 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 
149 aa  164  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 
145 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 
142 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 
149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  47.33 
 
 
150 aa  161  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.71 
 
 
149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 
149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 
149 aa  158  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
156 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 
148 aa  159  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 
144 aa  158  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.65 
 
 
152 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 
149 aa  157  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 
153 aa  156  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 
151 aa  156  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 
153 aa  156  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 
147 aa  156  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 
145 aa  156  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 
151 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 
151 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  48 
 
 
150 aa  156  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 
151 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 
146 aa  155  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 
146 aa  155  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.94 
 
 
145 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 
152 aa  155  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 
148 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
151 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.66 
 
 
150 aa  155  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.65 
 
 
148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 
151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 
148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 
145 aa  154  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 
152 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.45 
 
 
145 aa  153  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 
145 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 
142 aa  153  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.85 
 
 
137 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  47.26 
 
 
146 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 
151 aa  152  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
145 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
146 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  52.63 
 
 
152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
146 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 
160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
146 aa  151  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
146 aa  151  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
146 aa  151  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  55.38 
 
 
147 aa  151  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 
151 aa  151  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  51.68 
 
 
157 aa  151  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
146 aa  151  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  52.59 
 
 
150 aa  151  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
146 aa  151  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  48.34 
 
 
156 aa  151  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 
149 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 
148 aa  150  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  57.35 
 
 
145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 
151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 
150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.11 
 
 
145 aa  150  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 
149 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 
144 aa  149  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.75 
 
 
142 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 
144 aa  149  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 
162 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.03 
 
 
165 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 
149 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 
148 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
146 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  48.65 
 
 
152 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  47.44 
 
 
150 aa  148  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0546  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 
149 aa  148  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 
147 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  53.44 
 
 
144 aa  148  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 
145 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 
153 aa  148  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 
144 aa  148  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 
146 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  44.3 
 
 
150 aa  148  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
155 aa  147  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 
184 aa  147  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>