More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1211 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 		 155 aa  318  9.999999999999999e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  79.33 
 
 		 159 aa  252  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  75.48 
 
 		 159 aa  248  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  76 
 
 		 159 aa  245  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  67.74 
 
 		 159 aa  228  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  67.74 
 
 		 159 aa  228  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  69.66 
 
 		 160 aa  228  2e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  67.1 
 
 		 159 aa  227  5e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  69.93 
 
 		 160 aa  224  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  71.14 
 
 		 160 aa  224  3e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  52.74 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  53.42 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.99 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.24 
 
 		 145 aa  160  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.32 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 152 aa  155  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.07 
 
 		 149 aa  153  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 		 149 aa  150  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 147 aa  150  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  47.68 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  147  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.95 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.74 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  51.88 
 
 		 152 aa  147  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 145 aa  144  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.38 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  49.25 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.29 
 
 		 150 aa  144  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  46 
 
 		 149 aa  144  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  44.52 
 
 		 146 aa  144  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.89 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  48.15 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0383  3-dehydroquinate dehydratase  51.52 
 
 		 166 aa  140  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.21 
 
 		 147 aa  141  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 146 aa  140  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  54.62 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.21 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 144 aa  140  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  45.16 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  51.13 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  47.26 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  45.07 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 		 151 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.25 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  45.83 
 
 		 150 aa  138  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  51.15 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414343 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  48.51 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  46.53 
 
 		 172 aa  137  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>