More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0784 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 173 aa  358  2e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  71.62 
 
 		 151 aa  225  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  74.83 
 
 		 166 aa  223  9e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  73.97 
 
 		 153 aa  223  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  71.23 
 
 		 151 aa  221  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  70.75 
 
 		 151 aa  218  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  64.63 
 
 		 162 aa  198  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  58.11 
 
 		 147 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 145 aa  160  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 153 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 153 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.08 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  52.59 
 
 		 141 aa  148  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  51.33 
 
 		 147 aa  148  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.28 
 
 		 145 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.76 
 
 		 138 aa  147  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.63 
 
 		 137 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 142 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 146 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.21 
 
 		 148 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 146 aa  144  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 146 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 146 aa  144  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 146 aa  144  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 146 aa  144  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 146 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 146 aa  144  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 148 aa  143  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  51.7 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.76 
 
 		 137 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.18 
 
 		 145 aa  142  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  142  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  54.68 
 
 		 161 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.69 
 
 		 150 aa  141  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.14 
 
 		 144 aa  141  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  44.9 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  53.74 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.7 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  48.65 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.11 
 
 		 142 aa  138  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.03 
 
 		 152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 146 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 		 160 aa  138  4.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  42.76 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 144 aa  137  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 144 aa  137  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  44.14 
 
 		 159 aa  137  8.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 142 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1422  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 155 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216842  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0067  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.17 
 
 		 139 aa  136  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463951  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  45.77 
 
 		 147 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2435  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 142 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.476649 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  47.65 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  43.15 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 145 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2481  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.3 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  46.05 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  46.62 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  43.36 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  51.09 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  44.37 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 149 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6025  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 147 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212804  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2097  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  45.58 
 
 		 149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  44.51 
 
 		 193 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  44.51 
 
 		 193 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 161 aa  131  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  46.71 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 191 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  48.32 
 
 		 150 aa  130  7.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 		 150 aa  130  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  43.9 
 
 		 193 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  43.29 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>