More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11973 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 144 aa  293  5e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  67.15 
 
 		 137 aa  202  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  60.29 
 
 		 145 aa  180  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0067  3-dehydroquinate dehydratase, type II  65.69 
 
 		 139 aa  176  8e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463951  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.47 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.68 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2174  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.39 
 
 		 140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  52.41 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 		 159 aa  149  8.999999999999999e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 141 aa  148  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2435  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.17 
 
 		 142 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.476649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.9 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.31 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 145 aa  144  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 145 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.53 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 148 aa  140  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 147 aa  140  6e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  44.97 
 
 		 193 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0546  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  45.77 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  45.77 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  47.62 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.53 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  44.14 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 191 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 173 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.55 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  49.25 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  46.26 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 144 aa  135  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  44.06 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  51.18 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  44.14 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.76 
 
 		 184 aa  134  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 		 176 aa  134  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  45.95 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  46.04 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  43.62 
 
 		 193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  43.62 
 
 		 193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.07 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  43.62 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  43.62 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  43.62 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  43.62 
 
 		 193 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  43.62 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  42.76 
 
 		 150 aa  133  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4088  3-dehydroquinate dehydratase  45.77 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  44.2 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  48.89 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  44.68 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.21 
 
 		 152 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3593  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  43.24 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  44.2 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>