More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1544 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 166 aa  341  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  73.65 
 
 		 153 aa  229  9e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  74.32 
 
 		 151 aa  228  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  73.97 
 
 		 151 aa  228  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  74.83 
 
 		 173 aa  223  8e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  60.9 
 
 		 162 aa  209  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  67.35 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 		 147 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.05 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 		 141 aa  154  6e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.09 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.47 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  52.63 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  52.78 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 149 aa  143  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.71 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1422  3-dehydroquinate dehydratase  48.72 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 150 aa  142  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  46.04 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  46.04 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  45.28 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 		 142 aa  140  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  45.32 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 144 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.06 
 
 		 138 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.22 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.11 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.77 
 
 		 142 aa  139  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.1 
 
 		 150 aa  137  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.98 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  46.53 
 
 		 149 aa  137  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2481  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 		 149 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  52 
 
 		 155 aa  137  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  45.75 
 
 		 152 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  58.59 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  52.17 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.9 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.63 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0373  3-dehydroquinate dehydratase  47.95 
 
 		 159 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131464 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 		 146 aa  134  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 152 aa  133  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 141 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.64 
 
 		 145 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 145 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  46.53 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  41.94 
 
 		 155 aa  132  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.22 
 
 		 149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  47.74 
 
 		 157 aa  131  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 		 144 aa  131  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  47.74 
 
 		 176 aa  131  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 151 aa  131  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 		 144 aa  131  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1588  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.53 
 
 		 142 aa  130  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 145 aa  130  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  46.98 
 
 		 151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  43.97 
 
 		 147 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  46.32 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  45.27 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  48.87 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 145 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 193 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  47.26 
 
 		 162 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 146 aa  128  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.9 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>