More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3637 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 		 142 aa  286  9e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.96 
 
 		 147 aa  153  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.14 
 
 		 138 aa  147  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 146 aa  146  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 146 aa  146  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 207 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 		 207 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 207 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.93 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 146 aa  144  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 146 aa  144  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.55 
 
 		 142 aa  143  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.2 
 
 		 184 aa  142  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 155 aa  141  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  54.89 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 155 aa  141  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.55 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 141 aa  140  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 151 aa  140  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 		 144 aa  140  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3689  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  54.14 
 
 		 151 aa  139  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.62 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 191 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 152 aa  136  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.81 
 
 		 160 aa  136  7.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 147 aa  136  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  43.97 
 
 		 159 aa  136  8.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 159 aa  135  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  53.44 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  56.82 
 
 		 156 aa  135  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 156 aa  135  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 159 aa  135  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.64 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 		 178 aa  134  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  46.1 
 
 		 159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  48.2 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.25 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  47.41 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  44.68 
 
 		 160 aa  133  7.000000000000001e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 152 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.64 
 
 		 142 aa  133  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  51.91 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.89 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0067  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2435  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.11 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.476649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  54.89 
 
 		 145 aa  131  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.35 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>