More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_04381 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
147 aa  292  8e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  97.96 
 
 
147 aa  286  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  85.52 
 
 
146 aa  252  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0383  3-dehydroquinate dehydratase  87.05 
 
 
166 aa  246  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  64.79 
 
 
145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  64.08 
 
 
145 aa  196  7e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21621  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0724958 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 
151 aa  170  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.17 
 
 
145 aa  167  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0502  3-dehydroquinate dehydratase  56.35 
 
 
146 aa  167  5e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0028378  normal  0.126583 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  55.47 
 
 
153 aa  166  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 
149 aa  166  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03831  3-dehydroquinate dehydratase  55.81 
 
 
148 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 
144 aa  163  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  44.37 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
153 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
153 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1833  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 
146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.120538  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 
150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 
162 aa  160  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 
148 aa  160  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 
149 aa  159  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.29 
 
 
152 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
151 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
145 aa  159  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 
163 aa  159  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  48.28 
 
 
146 aa  158  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
145 aa  158  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.68 
 
 
152 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0768  3-dehydroquinate dehydratase  52 
 
 
167 aa  159  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000317323  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  47.26 
 
 
150 aa  158  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.11 
 
 
149 aa  158  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
153 aa  158  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 
152 aa  158  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 
149 aa  157  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 
150 aa  157  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 
178 aa  157  6e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
156 aa  156  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 
146 aa  156  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 
172 aa  156  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 
150 aa  156  8e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 
156 aa  156  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 
149 aa  156  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 
155 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
207 aa  155  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 
155 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
151 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
150 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
150 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
207 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 
156 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
145 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1476  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 
178 aa  155  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657033  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
150 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
150 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 
144 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 
144 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
150 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
150 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 
150 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
150 aa  154  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 
151 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 
150 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
207 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3593  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
148 aa  155  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
158 aa  154  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 
150 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 
144 aa  154  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 
146 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
147 aa  154  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
146 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 
146 aa  154  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 
144 aa  154  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
146 aa  154  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 
146 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 
146 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 
153 aa  154  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 
145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 
150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 
151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 
150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 
160 aa  153  6e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.32 
 
 
150 aa  153  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 
150 aa  153  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.71 
 
 
148 aa  153  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  48.3 
 
 
151 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 
149 aa  152  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
161 aa  153  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
154 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
150 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
148 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0032  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 
148 aa  152  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  49.65 
 
 
149 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.8 
 
 
155 aa  152  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
146 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0040  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 
244 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
179 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.7 
 
 
144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>