More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1474 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 		 152 aa  304  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  70.63 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  64.83 
 
 		 150 aa  201  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  68.28 
 
 		 150 aa  200  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  65.31 
 
 		 150 aa  200  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  64.58 
 
 		 152 aa  199  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  65.97 
 
 		 153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  65.97 
 
 		 153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  64.79 
 
 		 150 aa  191  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  63.09 
 
 		 149 aa  191  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  65.49 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  61.11 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  64.79 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.27 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  62.04 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 159 aa  171  5e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  58.5 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  52.03 
 
 		 159 aa  167  4e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  58.39 
 
 		 176 aa  167  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.84 
 
 		 184 aa  166  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 151 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 145 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 191 aa  164  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  52.78 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.33 
 
 		 160 aa  163  9e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 147 aa  163  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.99 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 		 152 aa  160  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  55.41 
 
 		 151 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 156 aa  158  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.73 
 
 		 150 aa  157  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  54.73 
 
 		 150 aa  157  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 148 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 		 157 aa  157  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  51.33 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 148 aa  157  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 		 147 aa  156  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 		 147 aa  156  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.03 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  57.78 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  58.09 
 
 		 162 aa  155  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  56.55 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.41 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 176 aa  154  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 160 aa  154  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  51.7 
 
 		 156 aa  154  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  52.78 
 
 		 157 aa  154  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 		 148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 		 207 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  54.62 
 
 		 147 aa  154  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 150 aa  154  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 150 aa  154  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 145 aa  153  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 150 aa  153  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  54.73 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  53.44 
 
 		 144 aa  151  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  54.73 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  54.73 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  52.78 
 
 		 151 aa  151  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 		 151 aa  150  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 207 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 148 aa  150  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 207 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.21 
 
 		 142 aa  150  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  60.71 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  54.05 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 150 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 150 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 150 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 150 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 150 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>