More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2300 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  58.5 
 
 
150 aa  187  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  63.24 
 
 
145 aa  184  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  63.97 
 
 
145 aa  183  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  61.54 
 
 
149 aa  181  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  63.97 
 
 
148 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  58.7 
 
 
142 aa  175  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  57.97 
 
 
146 aa  174  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 
145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  61.76 
 
 
155 aa  170  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  58.82 
 
 
142 aa  169  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.64 
 
 
150 aa  169  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  55.48 
 
 
151 aa  167  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 
146 aa  167  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 
144 aa  167  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  55.48 
 
 
151 aa  166  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 
153 aa  166  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.64 
 
 
152 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 
151 aa  166  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 
149 aa  166  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 
151 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 
151 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 
151 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0349681 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  53.9 
 
 
153 aa  165  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 
150 aa  165  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  55.48 
 
 
151 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  52.38 
 
 
160 aa  164  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 
149 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 
152 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 
191 aa  164  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 
151 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 
159 aa  163  6.9999999999999995e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  59.46 
 
 
151 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 
159 aa  163  6.9999999999999995e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 
145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 
149 aa  163  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
146 aa  163  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 
149 aa  163  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
146 aa  163  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 
148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  53.42 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 
146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 
149 aa  161  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 
149 aa  161  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 
153 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 
153 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.74 
 
 
184 aa  161  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
146 aa  161  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 
146 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 
150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 
146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 
159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 
159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 
152 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.86 
 
 
144 aa  160  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 
150 aa  159  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 
153 aa  159  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 
159 aa  159  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 
156 aa  159  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.79 
 
 
147 aa  159  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 
151 aa  158  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 
147 aa  158  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.15 
 
 
165 aa  158  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.82 
 
 
152 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
145 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 
151 aa  158  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
145 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 
152 aa  157  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 
176 aa  157  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 
160 aa  157  5e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
146 aa  156  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.14 
 
 
142 aa  155  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 
156 aa  155  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.52 
 
 
142 aa  155  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
160 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 
146 aa  154  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 
147 aa  154  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  55.64 
 
 
148 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 
148 aa  154  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 
161 aa  154  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.34 
 
 
145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 
152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 
157 aa  153  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 
176 aa  153  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 
144 aa  153  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.3 
 
 
160 aa  153  8e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
149 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 
148 aa  152  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 
149 aa  153  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 
150 aa  152  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 
146 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  52.41 
 
 
151 aa  151  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>