More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3243 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 144 aa  289  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  93.53 
 
 		 157 aa  267  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  73.85 
 
 		 147 aa  205  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  64.58 
 
 		 144 aa  197  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.71 
 
 		 145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 207 aa  174  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 207 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 150 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 150 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 150 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 150 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 150 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  59.57 
 
 		 207 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.7 
 
 		 149 aa  169  9e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  60.99 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  60.99 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 		 154 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.8 
 
 		 148 aa  167  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  59.57 
 
 		 150 aa  167  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 144 aa  166  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  58.87 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.97 
 
 		 145 aa  164  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  58.52 
 
 		 147 aa  163  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  60.99 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 150 aa  160  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 150 aa  159  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.63 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0209  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306548 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.15 
 
 		 144 aa  157  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.14 
 
 		 152 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 145 aa  156  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.43 
 
 		 146 aa  155  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.78 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.4 
 
 		 184 aa  155  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  55.15 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5722  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 149 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  58.99 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  55.22 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 172 aa  154  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 146 aa  153  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 146 aa  153  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3689  3-dehydroquinate dehydratase  58.87 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 149 aa  151  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 152 aa  151  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.35 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 146 aa  150  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.43 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.95 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 		 141 aa  150  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.43 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  50.34 
 
 		 153 aa  150  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  52.35 
 
 		 178 aa  150  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1719  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 144 aa  146  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0301155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>