More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3205 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 148 aa  291  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  75.52 
 
 		 207 aa  223  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  74.83 
 
 		 150 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  74.83 
 
 		 207 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  74.83 
 
 		 207 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  74.13 
 
 		 150 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  74.47 
 
 		 151 aa  217  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  73.43 
 
 		 150 aa  218  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  73.43 
 
 		 150 aa  218  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  74.83 
 
 		 150 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  74.83 
 
 		 150 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  74.83 
 
 		 150 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  74.83 
 
 		 150 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  74.83 
 
 		 150 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  74.47 
 
 		 151 aa  217  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  73.43 
 
 		 150 aa  217  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  73.43 
 
 		 150 aa  217  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  73.05 
 
 		 154 aa  214  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  71.94 
 
 		 162 aa  210  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3689  3-dehydroquinate dehydratase  74.31 
 
 		 150 aa  207  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  68.75 
 
 		 155 aa  204  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  68.75 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  74.82 
 
 		 162 aa  204  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  72.73 
 
 		 148 aa  204  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  68.75 
 
 		 155 aa  203  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  70.42 
 
 		 147 aa  203  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  71.83 
 
 		 151 aa  203  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  70.42 
 
 		 147 aa  201  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  70.42 
 
 		 147 aa  201  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  71.63 
 
 		 151 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  71.63 
 
 		 151 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  71.63 
 
 		 151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  70.21 
 
 		 150 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  70.21 
 
 		 150 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  69.72 
 
 		 149 aa  198  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  70.21 
 
 		 150 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  69.06 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  65.49 
 
 		 146 aa  194  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  64.54 
 
 		 149 aa  192  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  67.38 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  66.9 
 
 		 148 aa  191  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  68.57 
 
 		 172 aa  191  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  68.53 
 
 		 145 aa  189  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.5 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  63.12 
 
 		 149 aa  189  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0376  3-dehydroquinate dehydratase  68.49 
 
 		 153 aa  184  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.071732  normal  0.0167457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0197  3-dehydroquinate dehydratase  68.49 
 
 		 153 aa  184  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  61.97 
 
 		 145 aa  183  7e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  61.43 
 
 		 151 aa  183  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  61.27 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1053  3-dehydroquinate dehydratase  63.12 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000105156  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  60.99 
 
 		 152 aa  178  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2337  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.5 
 
 		 148 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  60.69 
 
 		 150 aa  177  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0040  3-dehydroquinate dehydratase  64.54 
 
 		 244 aa  176  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0032  3-dehydroquinate dehydratase  64.54 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  62.33 
 
 		 151 aa  174  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  60 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.74 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  60.43 
 
 		 148 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3363  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.24 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  61.97 
 
 		 149 aa  167  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  58.82 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  61.97 
 
 		 179 aa  165  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  61.7 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.86 
 
 		 184 aa  165  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 149 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3593  3-dehydroquinate dehydratase  58.22 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  60.87 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  60.74 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.04 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 153 aa  161  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  59.31 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1476  3-dehydroquinate dehydratase  56.46 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0534  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000293709  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 178 aa  160  6e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 		 148 aa  160  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0546  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 144 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 		 146 aa  159  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 146 aa  159  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 		 146 aa  159  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4088  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  60.56 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  60.74 
 
 		 147 aa  158  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.72 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0768  3-dehydroquinate dehydratase  57.93 
 
 		 167 aa  157  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000317323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0445  3-dehydroquinate dehydratase  60.99 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4416  3-dehydroquinate dehydratase  61.36 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0161291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>