More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0981 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 150 aa  304  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  84.56 
 
 		 150 aa  262  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  72.92 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  70.83 
 
 		 144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  69.44 
 
 		 149 aa  207  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  69.44 
 
 		 149 aa  205  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  64.83 
 
 		 152 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  62.07 
 
 		 150 aa  193  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  64.58 
 
 		 153 aa  193  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  64.58 
 
 		 153 aa  193  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.22 
 
 		 150 aa  187  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.64 
 
 		 152 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 		 145 aa  186  7e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  61.54 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 147 aa  180  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 149 aa  180  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.69 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  58.67 
 
 		 150 aa  178  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  52.74 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 		 147 aa  174  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.74 
 
 		 155 aa  171  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  63.7 
 
 		 162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  62.69 
 
 		 148 aa  170  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 145 aa  169  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 176 aa  168  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.11 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.82 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  61.48 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.44 
 
 		 184 aa  165  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.39 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  58.39 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  59.12 
 
 		 207 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0417  3-dehydroquinate dehydratase  57.97 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  59.12 
 
 		 207 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  60.74 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  60.74 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  58.52 
 
 		 207 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  60.74 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  59.12 
 
 		 150 aa  163  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  59.12 
 
 		 150 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  59.12 
 
 		 150 aa  163  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 		 151 aa  163  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 155 aa  163  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  59.12 
 
 		 150 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  59.12 
 
 		 150 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3996  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588334  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 156 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 156 aa  160  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.97 
 
 		 145 aa  161  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  59.7 
 
 		 148 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 151 aa  160  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  57.35 
 
 		 150 aa  160  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 150 aa  160  6e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.97 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 150 aa  160  7e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 176 aa  160  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 		 142 aa  159  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 157 aa  159  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4434  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433738 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  51.72 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0376  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.071732  normal  0.0167457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0197  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  58.52 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  54.68 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  58.96 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  58.78 
 
 		 154 aa  157  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  59.26 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  59.26 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 193 aa  157  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  57.35 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  57.35 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 151 aa  157  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 		 160 aa  156  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 162 aa  156  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 147 aa  156  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 		 146 aa  156  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  57.35 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>