More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2077 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 150 aa  304  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4700  3-dehydroquinate dehydratase  75.38 
 
 		 130 aa  215  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0672419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1437  3-dehydroquinate dehydratase  70.21 
 
 		 146 aa  206  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0623689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  62.41 
 
 		 145 aa  187  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  62.41 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  61.11 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  62.24 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  58.87 
 
 		 152 aa  174  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  62.32 
 
 		 149 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  60.43 
 
 		 176 aa  170  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  59.71 
 
 		 176 aa  169  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  60.43 
 
 		 157 aa  169  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  58.87 
 
 		 160 aa  167  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.43 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 151 aa  164  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 156 aa  163  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 		 163 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 156 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.74 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 150 aa  160  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 193 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 149 aa  157  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 150 aa  156  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  63.08 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 151 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 151 aa  153  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 151 aa  153  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 151 aa  153  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 151 aa  153  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 148 aa  153  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 193 aa  153  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 193 aa  153  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 193 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 149 aa  151  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.35 
 
 		 150 aa  151  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.8 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.94 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 191 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  51.95 
 
 		 158 aa  150  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 		 159 aa  150  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 149 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  45.32 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 145 aa  150  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 		 151 aa  150  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.28 
 
 		 145 aa  150  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 152 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 		 162 aa  149  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 207 aa  148  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.45 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>