More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1210 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 151 aa  308  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  83.33 
 
 		 151 aa  253  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  80.28 
 
 		 153 aa  235  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  73.97 
 
 		 166 aa  228  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  71.62 
 
 		 173 aa  225  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  70.47 
 
 		 151 aa  216  7e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  69.01 
 
 		 162 aa  209  9e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  57.93 
 
 		 147 aa  158  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.98 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 144 aa  150  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.86 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 145 aa  146  8e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  49.01 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  49.01 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.14 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.45 
 
 		 145 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  45.33 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 142 aa  143  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.9 
 
 		 144 aa  143  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.45 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.2 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.64 
 
 		 137 aa  141  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.45 
 
 		 142 aa  140  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  52.38 
 
 		 155 aa  140  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.69 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.85 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  44.67 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  44.22 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  44.83 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  51.02 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  44 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3996  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588334  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  47.3 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.68 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 143 aa  133  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  46.53 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  44.68 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4497  3-dehydroquinate dehydratase  47.3 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81741  normal  0.381959 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.23 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2097  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  43.84 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1559  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0672163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  49.33 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2438  3-dehydroquinate dehydratase type II  50 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0996759  normal  0.483602 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  46.04 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.38 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  46.98 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 151 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  44.6 
 
 		 144 aa  130  7.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0067  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 		 139 aa  130  7.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463951  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  49.33 
 
 		 176 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 144 aa  130  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0417  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>