More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2481 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2481  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 149 aa  308  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1422  3-dehydroquinate dehydratase  73.94 
 
 		 155 aa  217  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1952  3-dehydroquinate dehydratase  70.14 
 
 		 154 aa  209  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000216086  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0373  3-dehydroquinate dehydratase  70 
 
 		 159 aa  200  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131464 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1300  3-dehydroquinate dehydratase  64.38 
 
 		 150 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0501246  normal  0.27707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 145 aa  139  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  46.26 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.95 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  48.65 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.3 
 
 		 147 aa  130  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.06 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  44.37 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  44.3 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  44.3 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  44.37 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  45.07 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.89 
 
 		 152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.04 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.6 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  44.22 
 
 		 144 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  41.89 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  42.66 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  44.59 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  41.89 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  43.92 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  43.92 
 
 		 150 aa  122  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  47.33 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  44.37 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  40.14 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  39.19 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  40.14 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  43.45 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  43.45 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  43.45 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  43.45 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  43.62 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  43.75 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  43.45 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 151 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  42.57 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 		 158 aa  120  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  39.86 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  39.19 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 145 aa  120  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  42.67 
 
 		 150 aa  120  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  42.76 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.89 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  42.76 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  42.03 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.43 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  40.41 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.94 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  44.97 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  44.37 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  45 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  42.57 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  43.54 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  44.9 
 
 		 162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  40.54 
 
 		 159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  43.97 
 
 		 184 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  43.54 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2174  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.44 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  41.22 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 		 155 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  37.84 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 		 155 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0209  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 155 aa  116  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 		 151 aa  116  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  42.07 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  42.28 
 
 		 150 aa  115  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  39.74 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  46.94 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  41.78 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>