More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2547 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 
142 aa  289  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  60.61 
 
 
142 aa  174  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 
146 aa  174  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 
146 aa  173  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 
146 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 
146 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  59.09 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 
146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 
146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 
146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 
146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 
146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 
146 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  64.62 
 
 
147 aa  169  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 
146 aa  169  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 
147 aa  167  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.64 
 
 
145 aa  164  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.93 
 
 
145 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  58.46 
 
 
150 aa  160  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  56.62 
 
 
158 aa  160  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  57.97 
 
 
161 aa  159  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  55.38 
 
 
144 aa  157  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0209  3-dehydroquinate dehydratase  58.99 
 
 
155 aa  156  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0306548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 
153 aa  155  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3059  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 
157 aa  155  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00663855  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  59.54 
 
 
156 aa  155  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 
148 aa  155  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 
145 aa  155  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 
153 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 
153 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.61 
 
 
147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.73 
 
 
152 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 
150 aa  152  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  54.14 
 
 
149 aa  151  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 
149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.14 
 
 
148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  56.15 
 
 
150 aa  150  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 
150 aa  150  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  51.47 
 
 
153 aa  150  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 
146 aa  150  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
144 aa  150  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 
146 aa  150  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  49.62 
 
 
152 aa  150  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  54.68 
 
 
157 aa  149  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 
159 aa  149  8.999999999999999e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 
152 aa  149  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  49.25 
 
 
160 aa  147  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 
156 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
151 aa  147  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 
156 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.35 
 
 
165 aa  147  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 
148 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.82 
 
 
145 aa  147  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 
156 aa  146  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  55.38 
 
 
144 aa  146  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 
145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.45 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 
163 aa  144  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.38 
 
 
155 aa  144  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0659  dehydroquinase class II  47.86 
 
 
296 aa  144  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.969624  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 
156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.52 
 
 
184 aa  144  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  51.94 
 
 
147 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 
162 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.55 
 
 
142 aa  143  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 
145 aa  143  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  52.31 
 
 
150 aa  142  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 
148 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 
151 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 
150 aa  142  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 
151 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  45.99 
 
 
147 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2367  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.67 
 
 
144 aa  142  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0207637  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 
154 aa  141  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  52.59 
 
 
146 aa  141  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.85 
 
 
144 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 
153 aa  142  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.75 
 
 
152 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 
155 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 
155 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.1 
 
 
160 aa  141  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  52.63 
 
 
147 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  48.51 
 
 
159 aa  140  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 
156 aa  140  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  51.88 
 
 
147 aa  140  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 
162 aa  141  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 
149 aa  140  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 
145 aa  140  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 
147 aa  140  6e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 
172 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  51.13 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>