More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2345 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 		 137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  66.18 
 
 		 138 aa  199  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  61.76 
 
 		 145 aa  193  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.31 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2435  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.24 
 
 		 142 aa  176  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.476649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2174  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.5 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0067  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.82 
 
 		 139 aa  167  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463951  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.9 
 
 		 147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  56.62 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 148 aa  151  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 160 aa  151  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 142 aa  150  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 145 aa  147  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  54.14 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.47 
 
 		 144 aa  146  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.31 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 151 aa  145  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.59 
 
 		 145 aa  145  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  48.15 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 145 aa  143  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 145 aa  143  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 160 aa  143  8.000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 191 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 146 aa  143  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 144 aa  143  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 144 aa  143  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 144 aa  143  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.89 
 
 		 184 aa  142  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.74 
 
 		 145 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.88 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.89 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.55 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  47.41 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  48.89 
 
 		 144 aa  140  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  54.26 
 
 		 141 aa  140  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.63 
 
 		 152 aa  139  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  51.13 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  51.13 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  48.15 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.92 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  48.15 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  46.04 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  45.59 
 
 		 152 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  48.15 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  47.41 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  48.15 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.19 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0546  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  53.12 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  48.46 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 156 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.2 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  47.41 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  47.01 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  44.85 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  131  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 150 aa  131  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  46.27 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  48.51 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  44.93 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  47.33 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  45.8 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>