More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2178 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 148 aa  303  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2360  3-dehydroquinate dehydratase  82.84 
 
 		 149 aa  245  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.896861  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0417  3-dehydroquinate dehydratase  73.43 
 
 		 149 aa  218  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5767  3-dehydroquinate dehydratase  71.43 
 
 		 145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.533207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4497  3-dehydroquinate dehydratase  69.23 
 
 		 149 aa  209  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81741  normal  0.381959 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6025  3-dehydroquinate dehydratase  70.71 
 
 		 147 aa  207  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212804  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4434  3-dehydroquinate dehydratase  67.63 
 
 		 145 aa  203  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1559  3-dehydroquinate dehydratase  69.57 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0672163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3996  3-dehydroquinate dehydratase  69.57 
 
 		 148 aa  201  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5818  3-dehydroquinate dehydratase  68.61 
 
 		 146 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3003  3-dehydroquinate dehydratase  65.49 
 
 		 145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216438  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2097  3-dehydroquinate dehydratase  66.67 
 
 		 153 aa  196  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2690  3-dehydroquinate dehydratase  64.08 
 
 		 145 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 147 aa  173  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.86 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.15 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.15 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 156 aa  149  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 144 aa  147  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.35 
 
 		 184 aa  147  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.97 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 150 aa  143  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 145 aa  143  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 149 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  49.62 
 
 		 151 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  51.13 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4099  3-dehydroquinate dehydratase  68 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0790869  normal  0.677158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 145 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  48.87 
 
 		 154 aa  141  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3059  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00663855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  48.87 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 		 144 aa  141  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  52.59 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 		 144 aa  141  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  48.89 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  49.62 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  49.62 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.65 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.21 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 145 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 146 aa  140  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 147 aa  140  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  49.62 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  49.62 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2471  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.95 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 207 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  49.62 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.13 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2337  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.14 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2438  3-dehydroquinate dehydratase type II  47.92 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0996759  normal  0.483602 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  52.67 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  45.77 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 193 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  46.32 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  45.59 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  48.12 
 
 		 207 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.41 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.92 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  48.12 
 
 		 207 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  47.95 
 
 		 176 aa  136  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>