More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4097 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 		 165 aa  336  9e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  67.36 
 
 		 153 aa  204  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  65.49 
 
 		 154 aa  190  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  66.2 
 
 		 146 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  64.79 
 
 		 151 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  64.79 
 
 		 150 aa  187  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 148 aa  180  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  56.46 
 
 		 148 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  55.33 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  54.68 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  51.7 
 
 		 146 aa  167  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  55.41 
 
 		 158 aa  167  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  51.7 
 
 		 148 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  52.78 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.86 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  52.83 
 
 		 153 aa  160  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 156 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  52.41 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  51.35 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 148 aa  158  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  52.7 
 
 		 147 aa  158  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 		 153 aa  158  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.24 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.32 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 146 aa  157  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  51.03 
 
 		 145 aa  157  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  52.7 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  51.03 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  52.7 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  52.7 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  50.67 
 
 		 149 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  48.03 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  53.69 
 
 		 146 aa  155  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  55.1 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  50.66 
 
 		 151 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.48 
 
 		 144 aa  155  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  52.67 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  52.67 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  52.67 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  52.67 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  52.67 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  52.67 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  52.74 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  52.67 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  52.67 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  54.73 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.65 
 
 		 145 aa  154  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  153  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  54.68 
 
 		 147 aa  153  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.39 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  48.39 
 
 		 152 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.78 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  52.38 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  48.03 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  52.38 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  52.38 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  52.38 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  48.03 
 
 		 157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  52.38 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  50.66 
 
 		 160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  56.72 
 
 		 141 aa  151  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 148 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  47.37 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 149 aa  150  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 193 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 149 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 193 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  53.02 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 151 aa  150  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 151 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 151 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 151 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  52.7 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 151 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  48.03 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  51.7 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  48 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.35 
 
 		 142 aa  147  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  53.06 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>