More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12557 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12557  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 147 aa  292  8e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000372311  normal  0.0899495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  84.67 
 
 		 145 aa  238  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  84.67 
 
 		 145 aa  238  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  83.94 
 
 		 145 aa  236  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  66.43 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  63.38 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3150  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.59 
 
 		 144 aa  184  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.77 
 
 		 146 aa  184  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  59.85 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 143 aa  170  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  57.97 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  55.4 
 
 		 145 aa  155  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2415  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491796  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.05 
 
 		 156 aa  144  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  53.44 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 145 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0610  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.45 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  141  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  141  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  141  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 193 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 193 aa  141  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 193 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 176 aa  141  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  141  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.72 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 193 aa  141  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  52.59 
 
 		 150 aa  140  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0381  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.72 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  44.93 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.61 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  52.27 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  55.64 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.65 
 
 		 165 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.38 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 176 aa  137  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 156 aa  137  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.27 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1702  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.92 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  51.49 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 148 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 146 aa  136  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  48.85 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 150 aa  135  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.83 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17900  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348774  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  44.85 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  47.95 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  55.15 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2471  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.03 
 
 		 145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2438  3-dehydroquinate dehydratase type II  52.86 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0996759  normal  0.483602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  44.37 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.83 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.83 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  50.76 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.87 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4088  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  48.48 
 
 		 147 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>