More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6532 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 144 aa  292  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  80.56 
 
 		 144 aa  243  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  80.85 
 
 		 149 aa  238  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  75.97 
 
 		 149 aa  209  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  65.71 
 
 		 147 aa  201  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1702  3-dehydroquinate dehydratase, type II  67.61 
 
 		 145 aa  185  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0610  3-dehydroquinate dehydratase  61.54 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  63.83 
 
 		 143 aa  184  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  64.75 
 
 		 143 aa  184  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17900  3-dehydroquinate dehydratase  68.84 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348774  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  64.49 
 
 		 146 aa  180  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  64.96 
 
 		 143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0381  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.86 
 
 		 151 aa  177  4e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1333  3-dehydroquinate dehydratase  64.03 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.736952  normal  0.590383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2415  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 146 aa  159  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491796  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3150  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.66 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3032  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 145 aa  155  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  hitchhiker  0.000680386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  58.39 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.74 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12557  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000372311  normal  0.0899495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.07 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 152 aa  143  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 176 aa  143  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.53 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  45.83 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 146 aa  141  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 146 aa  141  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  45.77 
 
 		 146 aa  140  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 146 aa  140  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  47.95 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  47.95 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  47.95 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  45 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 142 aa  137  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 160 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  42.76 
 
 		 144 aa  136  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  41.55 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.01 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 193 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.62 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 193 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.1 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 193 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.45 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.45 
 
 		 145 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  45 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 148 aa  130  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>