More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0610 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0610  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 148 aa  309  6.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0381  3-dehydroquinate dehydratase, type II  79.86 
 
 		 151 aa  251  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  62.94 
 
 		 144 aa  190  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17900  3-dehydroquinate dehydratase  63.57 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348774  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.54 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  61.54 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 147 aa  177  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1702  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.57 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1333  3-dehydroquinate dehydratase  59.71 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.736952  normal  0.590383 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  58.65 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  58.39 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2415  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491796  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  56.2 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 161 aa  150  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3032  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  hitchhiker  0.000680386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.77 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12557  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 147 aa  142  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000372311  normal  0.0899495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.03 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  45.95 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  45.95 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  45.77 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  45.95 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  45.95 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  45.95 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  45.95 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  45.95 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  46.94 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  45.27 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  45.27 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.9 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  45.77 
 
 		 146 aa  137  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3150  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.72 
 
 		 144 aa  136  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 147 aa  136  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  50 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  45.27 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  43.45 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  46.94 
 
 		 153 aa  133  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  43.26 
 
 		 144 aa  131  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 		 193 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  45.83 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  44.08 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  44.53 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 		 151 aa  129  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 		 151 aa  129  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 		 151 aa  129  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  42.76 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  42.96 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  42.76 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  41.84 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  43.15 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  41.22 
 
 		 148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  43.66 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  42.86 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  41.38 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  44.37 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  42.76 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  42.47 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  44.83 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  44.06 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.14 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  43.45 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  41.1 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  41.84 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  42.57 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  41.78 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.37 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  42.47 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  43.88 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  40.69 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  38.89 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  40.82 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2438  3-dehydroquinate dehydratase type II  46.53 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0996759  normal  0.483602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  41.78 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  42.76 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  42.76 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  42.76 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  42.76 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  43.24 
 
 		 165 aa  123  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  43.06 
 
 		 193 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  43.06 
 
 		 193 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  43.06 
 
 		 193 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  41.84 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  42.38 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  42.18 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  41.13 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  43.92 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  41.38 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  42.96 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2471  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.83 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  43.15 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  40 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>